RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 GCLMP48507 274 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TRPV1Q8NER1 839 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 VTNP04004 478 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MFAP3P55082 362 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CLDN10P78369 228 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CBWD6Q4V339 395 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NT5C1BQ96P26 610 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CGRRF1Q99675 332 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 COQ4Q9Y3A0 265 aa24.5■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 GFPT2O94808 682 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NOL4O94818 638 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PROZP22891 400 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR49Q8IV35 697 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM117Q9H0C3 514 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 IFT122Q9HBG6 1241 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PHACTR2O75167 634 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CLTAP09496 248 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ACOT2P49753 483 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP3CAQ08209 521 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 EPC2Q52LR7 807 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB33Q86T24 672 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1328Q86T90 577 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB20Q9NX57 234 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TNNC2P02585 160 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TNNT1P13805 278 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 DLG4P78352 724 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 BIRC3Q13489 604 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 RAD9BQ6WBX8 426 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CD302Q8IX05 232 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 EPHB6O15197 1021 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT86O43790 486 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF5CO60282 957 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ACTN1P12814 892 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ELNP15502 786 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NOTUMQ6P988 496 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR59Q6PJI9 974 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 SESTD1Q86VW0 696 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 JAKMIP2Q96AA8 810 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 FHOD1Q9Y613 1164 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS4O75173 837 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PGK1P00558 417 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 GJB1P08034 283 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXC8P31273 242 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SOX5P35711 763 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3CAP42336 1068 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAM17P78536 824 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 IQCEQ6IPM2 695 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-212ENST00000591041 SV2AQ7L0J3 742 aa24.45■■□□□ 1.5
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