RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568443.2

CLN3-232, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-232ENST00000568443 ZBTB33Q86T24 672 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 DRC1Q96MC2 740 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 RXFP1Q9HBX9 757 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 CHST7Q9NS84 486 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 GDAQ9Y2T3 454 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 TECTAO75443 2155 aa24.73■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.73■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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CLN3-232ENST00000568443 B3GALT6Q96L58 329 aa24.73■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 RUSC1Q9BVN2 902 aa24.73■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 DPP7Q9UHL4 492 aa24.73■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 TMEM221A6NGB7 291 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 C2CD4DB7Z1M9 353 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 M0R296 226 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 PTGESO14684 152 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 PTPN21Q16825 1174 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 GPR149Q86SP6 731 aa24.72■■□□□ 1.55
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CLN3-232ENST00000568443 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.72■■□□□ 1.55
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CLN3-232ENST00000568443 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 C17orf75Q9HAS0 396 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.72■■□□□ 1.55
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CLN3-232ENST00000568443 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
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CLN3-232ENST00000568443 HYIQ5T013 277 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 GPR65Q8IYL9 337 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 PLIN2Q99541 437 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 TIPINQ9BVW5 301 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-232ENST00000568443 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
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CLN3-232ENST00000568443 MYO10Q9HD67 2058 aa24.7■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 SFI1A8K8P3 1242 aa24.7■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 SIGLEC14Q08ET2 396 aa24.7■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa24.7■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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CLN3-232ENST00000568443 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
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CLN3-232ENST00000568443 PALB2Q86YC2 1186 aa24.69■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 PLCD3Q8N3E9 789 aa24.69■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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CLN3-232ENST00000568443 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.68■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 BRAPQ7Z569 592 aa24.68■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.68■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.68■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 KREMEN2Q8NCW0 462 aa24.68■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.68■■□□□ 1.54
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CLN3-232ENST00000568443 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.68■■□□□ 1.54
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CLN3-232ENST00000568443 KIF4AO95239 1232 aa24.67■■□□□ 1.54
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CLN3-232ENST00000568443 SMTNP53814 917 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 FAM171A1Q5VUB5 890 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 CCDC149Q6ZUS6 474 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 CEP57Q86XR8 500 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 TTPALQ9BTX7 342 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-232ENST00000568443 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.67■■□□□ 1.54
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