RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 ZBTB33Q86T24 672 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 DRC1Q96MC2 740 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 GPR62Q9BZJ7 368 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 RXFP1Q9HBX9 757 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 CHST7Q9NS84 486 aa24.74■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 GDAQ9Y2T3 454 aa24.74■■□□□ 1.55
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CLN3-215ENST00000565236 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.73■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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CLN3-215ENST00000565236 B3GALT6Q96L58 329 aa24.73■■□□□ 1.55
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CLN3-215ENST00000565236 DPP7Q9UHL4 492 aa24.73■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 TMEM221A6NGB7 291 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 C2CD4DB7Z1M9 353 aa24.72■■□□□ 1.55
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CLN3-215ENST00000565236 PTPN21Q16825 1174 aa24.72■■□□□ 1.55
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CLN3-215ENST00000565236 KCTD17Q8N5Z5 321 aa24.72■■□□□ 1.55
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CLN3-215ENST00000565236 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.72■■□□□ 1.55
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CLN3-215ENST00000565236 KMT5AQ9NQR1 393 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.72■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.71■■□□□ 1.55
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CLN3-215ENST00000565236 HYIQ5T013 277 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 GPR65Q8IYL9 337 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 PBXIP1Q96AQ6 731 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 PLIN2Q99541 437 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 TIPINQ9BVW5 301 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 TMEM134Q9H6X4 195 aa24.71■■□□□ 1.55
CLN3-215ENST00000565236 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.71■■□□□ 1.55
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CLN3-215ENST00000565236 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.7■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 MYO10Q9HD67 2058 aa24.7■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 SFI1A8K8P3 1242 aa24.7■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 SIGLEC14Q08ET2 396 aa24.7■■□□□ 1.54
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CLN3-215ENST00000565236 PLCD3Q8N3E9 789 aa24.69■■□□□ 1.54
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CLN3-215ENST00000565236 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.68■■□□□ 1.54
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CLN3-215ENST00000565236 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa24.68■■□□□ 1.54
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CLN3-215ENST00000565236 SMTNP53814 917 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
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CLN3-215ENST00000565236 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 TTPALQ9BTX7 342 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.67■■□□□ 1.54
CLN3-215ENST00000565236 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.67■■□□□ 1.54
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