RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PARVGQ9HBI0 331 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 KCND2Q9NZV8 630 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 AKT3Q9Y243 479 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DENND3A2RUS2 1198 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CARNS1A5YM72 827 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 K7ENM7 598 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 MAGEB2O15479 319 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TSPAN1O60635 241 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ADSSP30520 456 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 THPOP40225 353 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 NAMPTP43490 491 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 EPHB4P54760 987 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 NLRP12P59046 1061 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GTF2BQ00403 316 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 NCAPHQ15003 741 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 FAM26DQ5JW98 314 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 UBXN11Q5T124 520 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 RPAINQ86UA6 219 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TMEM192Q8IY95 271 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ADSSL1Q8N142 457 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CEP120Q8N960 986 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 KIFAP3Q92845 792 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 KCNN1Q92952 543 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CPB2Q96IY4 423 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DRC1Q96MC2 740 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GSDMAQ96QA5 445 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 FZD8Q9H461 694 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GINS2Q9Y248 185 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC169A6NNP5 214 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DKK1O94907 266 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GHRP10912 638 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DARSP14868 501 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PROZP22891 400 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CD52P31358 61 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CCL23P55773 120 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ANO6Q4KMQ2 910 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 SEZ6Q53EL9 994 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TTI2Q6NXR4 508 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 KANK3Q6NY19 840 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 IRF2BP1Q8IU81 584 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TNS4Q8IZW8 715 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TOX2Q96NM4 488 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CBWD1Q9BRT8 395 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ERVK-5Q9HDB9 667 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 KMT5AQ9NQR1 393 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 EXOC1Q9NV70 894 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 TBX20Q9UMR3 447 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PPME1Q9Y570 386 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 AP5Z1O43299 807 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GAS2O43903 313 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GCNT3O95395 438 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 MYL1P05976 194 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ADRB2P07550 413 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CLTBP09497 229 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 GAP43P17677 238 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 CASP4P49662 377 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 STX17P56962 302 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF445P59923 1031 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 DSC3Q14574 896 aa9.11□□□□□ -0.95
TMOD3-211ENST00000561438 IQCB1Q15051 598 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms