RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 IFT74Q96LB3 600 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 DRC1Q96MC2 740 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBP1Q9H171 429 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CUTAO60888 179 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CTSAP10619 480 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 NOTUMQ6P988 496 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 URGCPQ8TCY9 931 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 IGSF21Q96ID5 467 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 REEP2Q9BRK0 252 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 STK17AQ9UEE5 414 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.05■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ACKR2O00590 384 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PRKCBP05771 671 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PLS3P13797 630 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF131P52739 623 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 EFNA5P52803 228 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 LONRF3Q496Y0 759 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PANK2Q9BZ23 570 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 POMKQ9H5K3 350 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CFAP45Q9UL16 551 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 USTQ9Y2C2 406 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 GALTP07902 379 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 TCF15Q12870 199 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 E2F4Q16254 413 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 MAPK6Q16659 721 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF39Q9H2S5 420 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ODF2LQ9ULJ1 636 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 IPPQ9Y573 584 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CACNA1HO95180 2353 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC169A6NNP5 214 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 OFD1O75665 1012 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 TXLNAP40222 546 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 HES2Q9Y543 173 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 MYMKA6NI61 221 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC16A4O15374 487 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 PDILTQ8N807 584 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 CNNM3Q8NE01 707 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNN1Q92952 543 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 FIZ1Q96SL8 496 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 K7ERI5 159 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 INPPL1O15357 1258 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 B4GALT3O60512 393 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 NPTXRO95502 500 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 ALDH2P05091 517 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 LIG1P18858 919 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 ME1P48163 572 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-210ENST00000559586 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms