RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 RARRES1P49788 294 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 STAT5BP51692 787 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 MTMR3Q13615 1198 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 KCNB1Q14721 858 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 XKR3Q5GH77 459 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 ANO5Q75V66 913 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GPBP1Q86WP2 473 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 OR6J1Q8NGC5 347 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 PPTC7Q8NI37 304 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 AFG1LQ8WV93 481 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 SMARCE1Q969G3 411 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 SPACA7Q96KW9 195 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GSDMAQ96QA5 445 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 CEP89Q96ST8 783 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF302Q9NR11 478 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 TRIM17Q9Y577 477 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 MYH11P35749 1972 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 FSD2A1L4K1 749 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM150BA6NC51 233 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 SEPT4O43236 478 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 RHOBTB3O94955 611 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 SMC2O95347 1197 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 LGALS2P05162 132 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 MMP3P08254 477 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 BMP6P22004 513 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GUCY2CP25092 1073 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GRK4P32298 578 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 SLC26A2P50443 739 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 NPEPPSP55786 919 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GJA9P57773 515 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 NLRP12P59046 1061 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 PRKCEQ02156 737 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 EHHADHQ08426 723 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 MORC3Q14149 939 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GIT2Q14161 759 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 MBTPS1Q14703 1052 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 XKR9Q5GH70 373 aa6.79□□□□□ -1.32
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CMTM1-220ENST00000534143 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 UNC13DQ70J99 1090 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 OTUD6AQ7L8S5 288 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 DYMQ7RTS9 669 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 TLK2Q86UE8 772 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 RAET1EQ8TD07 263 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 KCND2Q9NZV8 630 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 KAT6AQ92794 2004 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 ARHGEF35A5YM69 484 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 HAS3O00219 553 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 BIN1O00499 593 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 HBP1O60381 514 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 FAM13AO94988 1023 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC192P0DO97 292 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 ASIC1P78348 528 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 MAPK7Q13164 816 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 PLCB4Q15147 1175 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 DGKDQ16760 1214 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 TAF3Q5VWG9 929 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 PLA2G4FQ68DD2 849 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 ISM2Q6H9L7 571 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM1-220ENST00000534143 GLG1Q92896 1179 aa6.78□□□□□ -1.32
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