RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RRADP55042 308 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 KRT40Q6A162 431 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD3Q9Y597 815 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 GPR32O75388 356 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ITGA10O75578 1167 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 IL2RBP14784 551 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 DDCP20711 480 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SSPNQ14714 243 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ATP2B3Q16720 1220 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF568Q3ZCX4 644 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 MCTP2Q6DN12 878 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 IFI44Q8TCB0 444 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35A4Q96G79 324 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 WDCPQ9H6R7 721 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC9Q9Y397 364 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TEX33O43247 280 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 MYL3P08590 195 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TYRP14679 529 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 MALP21145 153 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 BPIFB4P59827 614 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TLE1Q04724 770 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 MESP2Q0VG99 397 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 CARFQ8N187 725 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ARMT1Q9H993 441 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ABCF2Q9UG63 623 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ADCY6O43306 1168 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 GUCY1A2P33402 732 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN7P35236 360 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SP140Q13342 867 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 LONRF1Q17RB8 773 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 RAB24Q969Q5 203 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRC-212ENST00000491302 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRC-212ENST00000491302 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 AMY1AP04745 511 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 ADCY7P51828 1080 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 CTXN1P60606 82 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 ATP8B2P98198 1209 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 PLS1Q14651 629 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 SRLQ86TD4 932 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 PGBD4Q96DM1 585 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRC-212ENST00000491302 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.52□□□□□ -0.89
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PTPRC-212ENST00000491302 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP6O43182 974 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 MYF5P13349 255 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 TM4SF4P48230 202 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 SNAPC2Q13487 334 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 NFYCQ13952 458 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 APOA5Q6Q788 366 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM151BQ8IW70 566 aa9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRC-212ENST00000491302 SLC38A3Q99624 504 aa9.51□□□□□ -0.89
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