RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 GAD1Q99259 594 aa23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF39Q9H2S5 420 aa23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF576Q9H609 170 aa23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.74■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 CTNNB1P35222 781 aa23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 STIM1Q13586 685 aa23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA20Q8TB22 786 aa23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 KLK14Q9P0G3 267 aa23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.73■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 INPPL1O15357 1258 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 MCM4P33991 863 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP1R2P41236 205 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ERVK-21P61565 698 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 GRIK3Q13003 919 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 CAMK4Q16566 473 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP120Q8N960 986 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ZFP42Q96MM3 310 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.72■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 POMCP01189 267 aa23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 SCNN1GP51170 649 aa23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM192Q8IY95 271 aa23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF558Q96NG5 402 aa23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 PLVAPQ9BX97 442 aa23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
RALGPS1-212ENST00000472427 TISP43B9A030 160 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 RB1P06400 928 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 PPM1AP35813 382 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 SNX27Q96L92 541 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA1586Q9HCI6 787 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa23.7■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 THP07101 528 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 BMPR1AP36894 532 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 SEZ6Q53EL9 994 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CD302Q8IX05 232 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 C17orf80Q9BSJ5 609 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 IKZF4Q9H2S9 585 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC38A7Q9NVC3 462 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.69■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 PDXKO00764 312 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 XPOTO43592 962 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 EXTL3O43909 919 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CXCL8P10145 99 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 ADSSP30520 456 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 HOXD13P35453 343 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 EPC2Q52LR7 807 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 GPD1LQ8N335 351 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 GPT2Q8TD30 523 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 TSPAN18Q96SJ8 248 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CBWD1Q9BRT8 395 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CWH43Q9H720 699 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CERS4Q9HA82 394 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 LAMA3Q16787 3333 aa23.68■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 PSMA7O14818 248 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGEF15O94989 841 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 ACOT2P49753 483 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 P2RX5Q93086 422 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM212AQ96EL1 285 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 SAAL1Q96ER3 474 aa23.67■■□□□ 1.38
RALGPS1-212ENST00000472427 TSG101Q99816 390 aa23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms