RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-208	ENST00000461648	KLK14	Q9P0G3	267 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	LCHN	A4D1U4	455 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	PDXK	O00764	312 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CLTA	P09496	248 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	MLH1	P40692	756 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	ARL5C	A6NH57	179 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CLIC2	O15247	247 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	INPPL1	O15357	1258 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	PPP1R2	P41236	205 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	TNFSF9	P41273	254 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	STIM1	Q13586	685 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	ADSSL1	Q8N142	457 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	URGCP	Q8TCY9	931 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	ZFP42	Q96MM3	310 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	TRIP11	Q15643	1979 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CA3	P07451	260 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	DNAJB2	P25686	324 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	FIBCD1	Q8N539	461 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	SAAL1	Q96ER3	474 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		27.79	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	ACOT2	P49753	483 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	NFKBIB	Q15653	356 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	LRRC43	Q8N309	656 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	SNX27	Q96L92	541 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	MIOS	Q9NXC5	875 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		27.78	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	PSMA7	O14818	248 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	EXTL3	O43909	919 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CXCL8	P10145	99 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	SCNN1G	P51170	649 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CYP2J2	P51589	502 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	GPD1L	Q8N335	351 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	TIFA	Q96CG3	184 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TSC2-208	ENST00000461648	LINC01553	A4QN01	128 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	POMC	P01189	267 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	CENPP	Q6IPU0	288 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	ANK1	P16157	1881 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		27.76	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	ARHGEF15	O94989	841 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	NR3C1	P04150	777 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	NLRP12	P59046	1061 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	NFIL3	Q16649	462 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	XKR4	Q5GH76	650 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSC2-208	ENST00000461648	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		27.75	■■■□□ 2.03

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