RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 H2AFVQ71UI9 128 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 MORC4Q8TE76 937 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 INPP5DQ92835 1189 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SLCO2A1Q92959 643 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 TBC1D31Q96DN5 1066 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SERPINB12Q96P63 405 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 WDR18Q9BV38 432 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ECT2Q9H8V3 914 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 AMFRQ9UKV5 643 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ASB3Q9Y575 518 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SCN4AP35499 1836 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 MSH4O15457 936 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 UBOX5O94941 541 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 DR1Q01658 176 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 NFIL3Q16649 462 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF280CQ8ND82 737 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC30A5Q8TAD4 765 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF536O15090 1300 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 RPTORQ8N122 1335 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ACADSP16219 412 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 COASYQ13057 564 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 RFFLQ8WZ73 363 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 DDX12PQ92771 950 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 LRMDAQ9H2I8 198 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ADAM22Q9P0K1 906 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 LINGO3P0C6S8 592 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 UCHL3P15374 230 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC18A1P54219 525 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 BACE1P56817 501 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 KRT79Q5XKE5 535 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 MDM1Q8TC05 714 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 LENG9Q96B70 501 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 KLHL29Q96CT2 875 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 OTUD5Q96G74 571 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC28BQ9BUN5 200 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 GRHL1Q9NZI5 618 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 DOCK1Q14185 1865 aa9.92□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 IRF6O14896 467 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 DIAPH2O60879 1101 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 PHF2O75151 1096 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 UNC5CO95185 931 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 POLR2MP0CAP2 368 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ATP6V1C1P21283 382 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 CTNNA2P26232 953 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 PTGIRP43119 386 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 RGS9BPQ6ZS82 235 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SESTD1Q86VW0 696 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 CATSPER3Q86XQ3 398 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 KSR1Q8IVT5 923 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 TPH2Q8IWU9 490 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 CHURC1Q8WUH1 139 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 SYT11Q9BT88 431 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 OTOFQ9HC10 1997 aa9.91□□□□□ -0.82
EFTUD2-201ENST00000402521 PFASO15067 1338 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms