RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391173.1

RNU6-400P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 400, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-400P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-400P-201ENST00000391173 C11orf42Q8N5U0 333 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CEP120Q8N960 986 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 DEPTORQ8TB45 409 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 DLG3Q92796 817 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 NUS1Q96E22 293 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 PRIMPOLQ96LW4 560 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 MIPEPQ99797 713 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 MXD3Q9BW11 206 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CARD11Q9BXL7 1154 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 PHACTR1Q9C0D0 580 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 KATNBL1Q9H079 304 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 NEUROD4Q9HD90 331 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CYTL1Q9NRR1 136 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ERVK13-1Q9NX77 482 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 KLHL13Q9P2N7 655 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 HEY2Q9UBP5 337 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 B4GALT7Q9UBV7 327 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 SERTAD1Q9UHV2 236 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZMYM5Q9UJ78 669 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CROTQ9UKG9 612 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 SIT1Q9Y3P8 196 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 RAD54BQ9Y620 910 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 WNT6Q9Y6F9 365 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 VWFP04275 2813 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 MYCBP2O75592 4640 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 A6NJY4 79 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 MARCH11A6NNE9 402 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 TMEM229AB2RXF0 380 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZNF878C9JN71 531 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 STK25O00506 426 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CDK2AP1O14519 115 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 BCL2L11O43521 198 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CBR3O75828 277 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 KRT36O76013 467 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 NDUFA10O95299 355 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 IGLV3-19P01714 112 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 KLKB1P03952 638 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 OATP04181 439 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 HOXB7P09629 217 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 TMEM191BP0C7N4 346 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 GLI4P10075 376 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CTSAP10619 480 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CAPN2P17655 700 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 HDCP19113 662 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 APLNRP35414 380 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 STAT3P40763 770 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 USP5P45974 858 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ARL4DP49703 201 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CTAG1AP78358 180 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 MOBPQ13875 183 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 POU4F3Q15319 338 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 TEAD4Q15561 434 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 UGP2Q16851 508 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CR1LQ2VPA4 569 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 MAP7D1Q3KQU3 841 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 TMEM30BQ3MIR4 351 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 TM4SF20Q53R12 229 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 C10orf25Q5T742 122 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 PIK3R6Q5UE93 754 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 BICRALQ6AI39 1079 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 WBP2NLQ6ICG8 309 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 LCN10Q6JVE6 187 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 SPSB3Q6PJ21 355 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 SASS6Q6UVJ0 657 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 LAYNQ6UX15 382 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CD300LDQ6UXZ3 194 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ZNF662Q6ZS27 426 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 IQCHQ86VS3 1027 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 GLYCTKQ8IVS8 523 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 FBXL14Q8N1E6 418 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 RFLNBQ8N5W9 214 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 MB21D1Q8N884 522 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 PIGOQ8TEQ8 1089 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 SSC4DQ8WTU2 575 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 SPIRE2Q8WWL2 714 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 MIEF2Q96C03 454 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-400P-201ENST00000391173 DHX58Q96C10 678 aa-0.99□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms