RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-202ENST00000367364 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 KCNAB3O43448 404 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 NRP2O60462 931 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM127O75204 238 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 CD40P25942 277 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRC-202ENST00000367364 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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PTPRC-202ENST00000367364 DPF1Q92782 380 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 CASS4Q9NQ75 786 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF4O60810 478 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 CELA2AP08217 269 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 NRG3P56975 720 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 DDB2Q92466 427 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 MSRAQ9UJ68 235 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 PRSS38A1L453 326 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC78A2IDD5 438 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 CXADRP78310 365 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 GPR162Q16538 588 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 C2orf27AQ580R0 203 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 NACC2Q96BF6 587 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 RNF31Q96EP0 1072 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 LCHNA4D1U4 455 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 JMJD7P0C870 316 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 PPARAQ07869 468 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRC-202ENST00000367364 SNX33Q8WV41 574 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 UROC1Q96N76 676 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 KAT6AQ92794 2004 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GTW7 788 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 PJA2O43164 708 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 TGM5O43548 720 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 PDPRQ8NCN5 879 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB9Q96C00 473 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 BOD1Q96IK1 185 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-202ENST00000367364 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 SDSP20132 328 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 FLT3LGP49771 235 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 RGS19P49795 217 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 CLRN1P58418 232 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 EFHBQ8N7U6 833 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 PRSS50Q9UI38 385 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
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PTPRC-202ENST00000367364 ONECUT2O95948 504 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 FGFR4P22455 802 aa6.01□□□□□ -1.45
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PTPRC-202ENST00000367364 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 MED25Q71SY5 747 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 GASTP01350 101 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 CANXP27824 592 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-202ENST00000367364 ITPKBP27987 946 aa6□□□□□ -1.45
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