RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362839.1

RNU4-23P-201, Transcript of RNA, U4 small nuclear 23, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU4-23P, Length 140 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU4-23P-201ENST00000362839 SNAPC2Q13487 334 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FGL2Q14314 439 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 USP10Q14694 798 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 AGBL4Q5VU57 503 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 REPS2Q8NFH8 660 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 LPPQ93052 612 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FAM167AQ96KS9 214 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 TBCBQ99426 244 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 OR10A2Q9H208 303 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 LANCL2Q9NS86 450 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ABCF2Q9UG63 623 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 SH3D21A4FU49 640 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 TOX4O94842 621 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ARIH2O95376 493 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 MED14OSP0DP75 135 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 MYF5P13349 255 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 DDCP20711 480 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 CAP1Q01518 475 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 MESP2Q0VG99 397 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 MCTP2Q6DN12 878 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 GPR155Q7Z3F1 870 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 Q8N3U1 123 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 PNPOQ9NVS9 261 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FNIP2Q9P278 1114 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 WNT10BO00744 389 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 MTSS1O43312 755 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FRS3O43559 492 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 GYPEP15421 78 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 PCSK1P29120 753 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 PIK3CBP42338 1070 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 SARSP49591 514 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ADCY7P51828 1080 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 DUSP2Q05923 314 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 MTM1Q13496 603 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ACAP1Q15027 740 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 TBR1Q16650 682 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 STON2Q8WXE9 905 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 RSAD1Q9HA92 442 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 TPCN1Q9ULQ1 816 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FFAR3O14843 346 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 GPR32O75388 356 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 KRT1P04264 644 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FPR1P21462 350 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 SMARCA1P28370 1054 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 BPIFB4P59827 614 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 USP30Q70CQ3 517 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 IL31RAQ8NI17 732 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ANKS1AQ92625 1134 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 PGBD4Q96DM1 585 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 APIPQ96GX9 242 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 CCDC138Q96M89 665 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 PLCB1Q9NQ66 1216 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 TMEM140Q9NV12 185 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 DMTF1Q9Y222 760 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 KCTD3Q9Y597 815 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 A0A1B0GTL3 188 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 PTPN7P35236 360 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 CTXN1P60606 82 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ADAM8P78325 824 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 HGFACQ04756 655 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU4-23P-201ENST00000362839 SKAP1Q86WV1 359 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms