RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPFIA2O75334 1257 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNA3P22001 575 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZDHHC24Q6UX98 284 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP85Q9BW27 656 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PXMP2Q9NR77 195 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTGIRP43119 386 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SP4Q02446 784 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 RUFY4Q6ZNE9 571 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 NIM1KQ8IY84 436 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 HELQQ8TDG4 1101 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP20Q9Y2K6 914 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.5■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR64B1ANS9 1081 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CYP11B1P15538 503 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHC3Q92529 594 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TATDN2Q93075 761 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PFASO15067 1338 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHF2O75151 1096 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 GHRHRQ02643 423 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 BIRC3Q13489 604 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT39Q6A163 491 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF653Q96CK0 615 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TEPSINQ96N21 525 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.49■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAND2O75155 1236 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPL21P46778 160 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNJ1P48048 391 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 LPAR1Q92633 364 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CD101Q93033 1021 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPOPO43791 374 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF862O60290 1169 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 MFAP3P55082 362 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP2R2AP63151 447 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHADLQ6NUI6 762 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATG4CQ96DT6 458 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.48■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 MDM1Q8TC05 714 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 GABBR1Q9UBS5 961 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM187AA6NFU0 413 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMIM23A6NLE4 172 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 VGLL3A8MV65 326 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAPK13O15264 365 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 GZMAP12544 262 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTNNA2P26232 953 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 JAK3P52333 1124 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMTNP53814 917 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 POMGNT1Q8WZA1 660 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 KAT2BQ92831 832 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP170P1Q96L14 293 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 STK32BQ9NY57 414 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 FZD1Q9UP38 647 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.47■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM107AO95990 144 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 PMS2P54278 862 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCEAL1Q15170 157 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 C2CD6Q53TS8 623 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 SV2AQ7L0J3 742 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 IWS1Q96ST2 819 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM7Q9C029 511 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAB20Q9NX57 234 aa21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERLIN2O94905 339 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms