RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538266.5

SNHG1-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG1, Length 347 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-208	ENST00000538266	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ICAM1	P05362	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CD247	P20963	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	COPB2	P35606	906 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	EVC	P57679	992 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ARHGEF6	Q15052	776 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FXN	Q16595	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	DUSP13	Q9UII6	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	NID2	Q14112	1375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MEIS1	O00470	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ZBTB5	O15062	677 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PFKFB2	O60825	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FKTN	O75072	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC25A27	O95847	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ESR1	P03372	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ALAS1	P13196	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	FUT4	P22083	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MAPK4	P31152	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	STAT3	P40763	770 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	OAZ1	P54368	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SNAP25	P60880	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SP3	Q02447	781 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	USH1G	Q495M9	461 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	COA7	Q96BR5	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	MROH8	Q9H579	483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG1-208	ENST00000538266	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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