RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 AKT3Q9Y243 479 aa18.52■□□□□ 0.56
PACS1-208ENST00000529677 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PROB1E7EW31 1015 aa18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 EFCAB14O75071 495 aa18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 GPR32O75388 356 aa18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PPP1R37O75864 691 aa18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PARNO95453 639 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 VTNP04004 478 aa18.51■□□□□ 0.55
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PACS1-208ENST00000529677 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 SAMD11Q96NU1 681 aa18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PRRX2Q99811 253 aa18.51■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACS1-208ENST00000529677 H0YCG3 227 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACS1-208ENST00000529677 ABCD1P33897 745 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 SMTNP53814 917 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PTENP60484 403 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 STK4Q13043 487 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACS1-208ENST00000529677 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 ZNF720Q7Z2F6 126 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 KSR1Q8IVT5 923 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACS1-208ENST00000529677 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 HVCN1Q96D96 273 aa18.5■□□□□ 0.55
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PACS1-208ENST00000529677 ZHX3Q9H4I2 956 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 KMT5AQ9NQR1 393 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 ZFHX4Q86UP3 3567 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa18.5■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 UBE4BO95155 1302 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 LOC730098B7Z3J9 87 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 GRM6O15303 877 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PHKA2P46019 1235 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 GTF2BQ00403 316 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 HAUS6Q7Z4H7 955 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 RNF149Q8NC42 400 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 HPS3Q969F9 1004 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.49■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 A0A087WZ62 844 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 SLC16A4O15374 487 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 NMT1P30419 496 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CASP5P51878 434 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 EFNA5P52803 228 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CAMK1Q14012 370 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 KIZQ2M2Z5 673 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 DEPTORQ8TB45 409 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 TOP1MTQ969P6 601 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 NLRP4Q96MN2 994 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 FUCA2Q9BTY2 467 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 TMEM134Q9H6X4 195 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CDY2AQ9Y6F7 541 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 SQORQ9Y6N5 450 aa18.48■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 KIAA1671Q9BY89 1806 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PRR23AA6NEV1 266 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CCDC169A6NNP5 214 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 H0Y858 1186 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 K7ENM7 598 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 CHRNA1P02708 482 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 AMHP03971 560 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 AVPR2P30518 371 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 THPOP40225 353 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 NLRP12P59046 1061 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 35.7
PACS1-208ENST00000529677 FAM187BQ17R55 369 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.47■□□□□ 0.55
PACS1-208ENST00000529677 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
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