RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 MARCH5Q9NX47 278 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 MIOSQ9NXC5 875 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TEX28O15482 410 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TADA2AO75478 443 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 AMHR2Q16671 573 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 STAMQ92783 540 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 WNT7AO00755 349 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 B4GALT5O43286 388 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 DSG1Q02413 1049 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 TCF15Q12870 199 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 GRIK3Q13003 919 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 USP41Q3LFD5 358 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA0319Q5VV43 1072 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 PIDD1Q9HB75 910 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 KLK14Q9P0G3 267 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 ARID2Q68CP9 1835 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF318Q5VUA4 2279 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 CREMQ03060 361 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF174Q15697 407 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.31■■□□□ 1
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SH3BP2-220ENST00000511663 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 N4BP3O15049 544 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 MED24O75448 989 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 OR52Z1P0C646 297 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 RPA1P27694 616 aa21.3■■□□□ 1
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SH3BP2-220ENST00000511663 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 TDGQ13569 410 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP2R5AQ15172 486 aa21.3■■□□□ 1
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SH3BP2-220ENST00000511663 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 FUT10Q6P4F1 479 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 PADI6Q6TGC4 694 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 PALB2Q86YC2 1186 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 DEPTORQ8TB45 409 aa21.3■■□□□ 1
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SH3BP2-220ENST00000511663 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 CHST7Q9NS84 486 aa21.3■■□□□ 1
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 C1RP00736 705 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 LIG1P18858 919 aa21.29■■□□□ 1
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM187BQ17R55 369 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR65Q8IYL9 337 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 IFT74Q96LB3 600 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 FZD8Q9H461 694 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.29■■□□□ 1
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SH3BP2-220ENST00000511663 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.29■■□□□ 1
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SH3BP2-220ENST00000511663 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 PHOX2BQ99453 314 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNK12Q9HB15 430 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 FNIP2Q9P278 1114 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 STK24Q9Y6E0 443 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 H0Y858 1186 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 EFEMP2O95967 443 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 THP07101 528 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 NAMPTP43490 491 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP2-220ENST00000511663 CLCN5P51795 746 aa21.27■■□□□ 1
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