RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF220	Q5VTB9	566 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	HAS1	Q92839	578 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KAT5	Q92993	513 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM161B	Q96MY7	647 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TRABD	Q9H4I3	376 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	AFF2	P51816	1311 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PDXK	O00764	312 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CIB2	O75838	187 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	POTEJ	P0CG39	1038 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CD58	P19256	250 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PIK3CA	P42336	1068 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	EPHA7	Q15375	998 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SLFN13	Q68D06	897 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	HES6	Q96HZ4	224 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KIF3C	O14782	793 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	GDF11	O95390	407 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SGPL1	O95470	568 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TTLL1	O95922	423 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CBWD6	Q4V339	395 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC27	Q6P3X3	843 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP3K7	O43318	606 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CNGA1	P29973	690 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KLRC3	Q07444	240 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM182B	Q5T319	152 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CHST7	Q9NS84	486 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TISP43	B9A030	160 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CAPN9	O14815	690 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KCNQ2	O43526	872 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DCTN3	O75935	186 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MXI1	P50539	228 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CLUL1	Q15846	466 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CENPT	Q96BT3	561 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SNF8	Q96H20	258 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NID2	Q14112	1375 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SGK1	O00141	431 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBTB5	O15062	677 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CDH16	O75309	829 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	BBS9	Q3SYG4	887 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	PALM2	Q8IXS6	379 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	COG5	Q9UP83	839 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	C5	P01031	1676 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ZBED4	O75132	1171 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	HAUS5	O94927	633 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	NFIX	Q14938	502 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXO11	Q86XK2	927 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	CNBD1	Q8NA66	436 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	KIFAP3	Q92845	792 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM84A	Q96KN4	292 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ERCC3-208	ENST00000491292	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73

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