RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 RUBCNQ92622 972 aa8.31□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.31□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 TLK2Q86UE8 772 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NLRP14Q86W24 1093 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TRIM58Q8NG06 486 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SPOCK2Q92563 424 aa8.31□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ACLYP53396 1101 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 STK38Q15208 465 aa8.3□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 C16orf87Q6PH81 154 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 MMS19Q96T76 1030 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TRPV5Q9NQA5 729 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ATP4AP20648 1035 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 POU5F1BQ06416 359 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 DBN1Q16643 649 aa8.3□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.3□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 RARBP10826 455 aa8.3□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 ATP9AO75110 1047 aa8.29□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 JAK3P52333 1124 aa8.29□□□□□ -1.08
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USP4-211ENST00000485450 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 P3H4Q92791 437 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 FAM81BQ96LP2 452 aa8.29□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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