RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	PPM1E	Q8WY54	764 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CENPH	Q9H3R5	247 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	GGPS1	O95749	300 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CYP1A2	P05177	515 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	DPEP1	P16444	411 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CNGA1	P29973	690 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CHRNA3	P32297	505 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SMTN	P53814	917 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TMC2	Q8TDI7	906 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	FBXL18	Q96ME1	805 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC169	A6NNP5	214 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MME	P08473	750 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MESD	Q14696	234 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SAAL1	Q96ER3	474 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ACP6	Q9NPH0	428 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TRPC6	Q9Y210	931 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	DENND3	A2RUS2	1198 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ZBED4	O75132	1171 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CP	P00450	1065 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CYP11B1	P15538	503 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CDR2	Q01850	454 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	BSND	Q8WZ55	320 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	C18orf8	Q96DM3	657 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	18.21	■□□□□ 0.51	1e-6	■■■■■ 101.7
TOM1-210	ENST00000449058	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	ERLIN2	O94905	339 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	GTF2H1	P32780	548 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	NLRP14	Q86W24	1093 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	KIFAP3	Q92845	792 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	VWA5A	O00534	786 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	STBD1	O95210	358 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	FAM107A	O95990	144 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	FDX1	P10109	184 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	SEC24C	P53992	1094 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	MTMR2	Q13614	643 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	CYP1B1	Q16678	543 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	TTC27	Q6P3X3	843 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	NSMF	Q6X4W1	530 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	GPRASP2	Q96D09	838 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	NT5C1B	Q96P26	610 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	NUP85	Q9BW27	656 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		18.2	■□□□□ 0.5
TOM1-210	ENST00000449058	RLF	Q13129	1914 aa		18.2	■□□□□ 0.5

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