RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 HSD17B14Q9BPX1 270 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 TMOD4Q9NZQ9 345 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 PLCG2P16885 1265 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 WASHC2DQ5SRD0 308 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 POTEGQ6S5H5 508 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SH2D5Q6ZV89 423 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 STK32BQ9NY57 414 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 PARP2Q9UGN5 583 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 GGT7Q9UJ14 662 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 FAM155BO75949 473 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 RFX1P22670 979 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 RPS6KA3P51812 740 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 LONRF1Q17RB8 773 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 STAT1P42224 750 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SAAL1Q96ER3 474 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 RAB34Q9BZG1 259 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 LCTP09848 1927 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 LRRN2O75325 713 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SIK1P57059 783 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 OCRLQ01968 901 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 NAA25Q14CX7 972 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 TANGO6Q9C0B7 1094 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 NINJ2Q9NZG7 142 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SUN1O94901 812 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 IL1BP01584 269 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 STAT3P40763 770 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 PTP4A2Q12974 167 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC38Q502W7 563 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 RUNDC3BQ96NL0 473 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 KCNK13Q9HB14 408 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.173e-6■■■□□ 16.3
HOXB4-201ENST00000332503 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 AGPAT1Q99943 283 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 WNT8AQ9H1J5 351 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 FAM86B1E9PN63 330 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 CYP3A4P08684 503 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 COG2Q14746 738 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 ODF2Q5BJF6 829 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
HOXB4-201ENST00000332503 IRF6O14896 467 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 MYBPC2Q14324 1141 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 TRABD2AQ86V40 505 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 AMIGO3Q86WK7 504 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 NLRP3Q96P20 1036 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 GZMAP12544 262 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 COMTP21964 271 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 C17orf75Q9HAS0 396 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 ATP2C2O75185 946 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXB4-201ENST00000332503 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms