RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294161.10

TTC9C-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC9C, Length 1,833 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9C-201ENST00000294161 ADRB2P07550 413 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 USP8P40818 1118 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 GPC5P78333 572 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 SLFN12LQ6IEE8 588 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 CBWD2Q8IUF1 395 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 METTL13Q8N6R0 699 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 WHAMMQ8TF30 809 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ISCUQ9H1K1 167 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ZNF302Q9NR11 478 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 PPME1Q9Y570 386 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 PTPRFP10586 1907 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 HSF2BPO75031 334 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ATG7O95352 703 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ABCB4P21439 1286 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ADSSP30520 456 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 COPB2P35606 906 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 RFC5P40937 340 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 LIG4P49917 911 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 PPATQ06203 517 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 CYP24A1Q07973 514 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 GRM1Q13255 1194 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 CUL1Q13616 776 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 C11orf63Q6NUN7 778 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 RIOX2Q8IUF8 465 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 PPM1KQ8N3J5 372 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 PLEKHO2Q8TD55 490 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 SHC3Q92529 594 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 CCDC127Q96BQ5 260 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 EPB41L5Q9HCM4 733 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 RAB20Q9NX57 234 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 FAN1Q9Y2M0 1017 aa15.94■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 CEP350Q5VT06 3117 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 SPDYE5A6NIY4 337 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 KRIT1O00522 736 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 EXTL3O43909 919 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 OATP04181 439 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 MYBL2P10244 700 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 GUCY2DQ02846 1103 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 EMC2Q15006 297 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 LBX2Q6XYB7 198 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 OLIG1Q8TAK6 271 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 BSNDQ8WZ55 320 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 SAAL1Q96ER3 474 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 CARD9Q9H257 536 aa15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 GOLGA8KD6RF30 607 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 LDHAP00338 332 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 FTLP02792 175 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 NAMPTP43490 491 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 SP4Q02446 784 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 NEDD9Q14511 834 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 MTERF2Q49AM1 385 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 DEPTORQ8TB45 409 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 SLC7A3Q8WY07 619 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 THAP2Q9H0W7 228 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 RNF40O75150 1001 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 TGFB3P10600 412 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 HSPA6P17066 643 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 PDE6CP51160 858 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 BPIFB4P59827 614 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 FKBP1BP68106 108 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 PPFIA1Q13136 1202 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ERO1BQ86YB8 467 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 KLHL7Q8IXQ5 586 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 EXOC8Q8IYI6 725 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 MREGQ8N565 214 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 ARID2Q68CP9 1835 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 TMEM88BA6NKF7 163 aa15.91■□□□□ 0.14
TTC9C-201ENST00000294161 MTA2O94776 668 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms