RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 PSMB7Q99436 277 aa25.98■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 ATP8B3O60423 1300 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 RHOXF2BP0C7M4 288 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 CXCR5P32302 372 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 ACOT2P49753 483 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 MSANTD4Q8NCY6 345 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 RHOXF2Q9BQY4 288 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 RAB20Q9NX57 234 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 INTUQ9ULD6 942 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 FTCDO95954 541 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 TCP1P17987 556 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 TNFAIP3P21580 790 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 SPRYD7Q5W111 196 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF516Q92618 1163 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.97■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 GALCP54803 685 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 WNT7BP56706 349 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 PSMD6Q15008 389 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 PNKPQ96T60 521 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 AGPAT1Q99943 283 aa25.96■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 TMCO5BA8MYB1 307 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 USP8P40818 1118 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 NOP2P46087 812 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 ARHGAP1Q07960 439 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 HELQQ8TDG4 1101 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 PTPN18Q99952 460 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN13-201ENST00000262067 A0A0B4J269 797 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 STRNO43815 780 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC26A2P50443 739 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 MFAP3P55082 362 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 CLDN10P78369 228 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 MEI1Q5TIA1 1274 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 PALB2Q86YC2 1186 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 TCP11Q8WWU5 503 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 TSKSQ9UJT2 592 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 TRPC6Q9Y210 931 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 SIP14410 1827 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 TTLL13PA6NNM8 815 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 NT5C1BQ96P26 610 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 GAS2O43903 313 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 SHC3Q92529 594 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 TATDN2Q93075 761 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 FNBP1Q96RU3 617 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 PDE11AQ9HCR9 933 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 TAS2R14Q9NYV8 317 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 SGPL1O95470 568 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 EFNA5P52803 228 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 VTA1Q9NP79 307 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 LDHAP00338 332 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 LAMC2Q13753 1193 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 GPR142Q7Z601 462 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 RNF149Q8NC42 400 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 TPCN2Q8NHX9 752 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 RAB21Q9UL25 225 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN13-201ENST00000262067 FAM170AA1A519 330 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms