RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Inpp5bQ8K337 993 aa14.68□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tor1aip1Q921T2 595 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mcrs1Q99L90 462 aa14.68□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa14.68□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Copb2O55029 905 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mucl2P02815 138 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Il2P04351 169 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Usp4P35123 962 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kmt5aQ2YDW7 349 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Brinp3Q499E0 766 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ece1Q4PZA2 769 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dlgap3Q6PFD5 977 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem132dQ76HP3 1097 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 BicralQ8CHH5 1074 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nt5c3aQ9D020 331 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rfx8D3YU81 596 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nccrp1G3X9C2 266 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 BegainQ68EF6 600 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf280dQ68FE8 974 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 C2cd2lQ80X80 706 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tspan9Q8BJU2 239 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CbsQ91WT9 561 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cxcl11Q9JHH5 100 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gmeb1Q9JL60 562 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Anapc7Q9WVM3 565 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kank3Q9Z1P7 791 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Exoc4O35382 975 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pde8aO88502 823 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Axin2O88566 840 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prkaa1Q5EG47 559 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmtc3Q8BRH0 920 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cep95Q8BVV7 827 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Galnt5Q8C102 930 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Adi1Q99JT9 179 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mzt2Q9CQ25 159 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hao1Q9WU19 370 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kif13aQ9EQW7 1749 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc35g2D3YVE8 412 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NuggcD3YWJ0 796 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm3402K7N5P2 326 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ap1s3Q7TN05 154 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cpa1Q7TPZ8 419 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Net1Q9Z206 595 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Wdr19Q3UGF1 1341 aa14.67□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Speer4cG3UXD1 256 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm10354K7N6A0 256 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lire1P11260 357 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rag1P15919 1040 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Serping1P97290 504 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NfibP97863 570 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rpa3Q9CQ71 121 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fdx1P46656 188 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pdcd2P46718 343 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Abce1P61222 599 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 VcpQ01853 806 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Oca2Q62052 833 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gucy2gQ6TL19 1100 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Capn7Q9R1S8 813 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Vmn2r71L7N2D8 855 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc12a1P55014 1095 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ddr1Q03146 911 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Capn11Q6J756 714 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Prpf4Q9DAW6 521 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Phtf1Q9QZ09 761 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gadd45gQ9Z111 159 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ttc38A3KMP2 465 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Grk4O70291 574 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Asap3Q5U464 904 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt73Q6NXH9 539 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hps4Q99KG7 671 aa14.66□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccng2O08918 344 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 DffaO54786 331 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hmx1O70218 332 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ppp3ccP48455 513 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fra10ac1Q8BP78 315 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Snx30Q8CE50 437 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ChiaQ91XA9 473 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Drap1Q9D6N5 205 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Thap11Q9JJD0 305 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Spef2Q8C9J3 1734 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 DccP70211 1447 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MlxipQ2VPU4 917 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trpc5osQ3UHV4 110 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Adrbk2Q3UYH7 688 aa14.65□□□□□ -0.06
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mrps26Q80ZS3 200 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.6 ms