RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 PAEPP09466 180 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 GCKP35557 465 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 DNA2P51530 1060 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 QPCTQ16769 361 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 RDH13Q8NBN7 331 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 CCT6BQ92526 530 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 GPR88Q9GZN0 384 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM206Q9H813 350 aa22.05■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 ATP9AO75110 1047 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 PLS3P13797 630 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 ALCAMQ13740 583 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 ACCSLQ4AC99 568 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 INTUQ9ULD6 942 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 H2AFZP0C0S5 128 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 H2AFVQ71UI9 128 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.04■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 ZBED4O75132 1171 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 MYL7Q01449 175 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 UGCGQ16739 394 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 C4orf19Q8IY42 314 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 LMO3Q8TAP4 145 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 RMDN3Q96TC7 470 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 SYT11Q9BT88 431 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 PXMP2Q9NR77 195 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 TISP43B9A030 160 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 CES2O00748 559 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 RPS6KA1Q15418 735 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 ACCSQ96QU6 501 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 HACL1Q9UJ83 578 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 PNMA2Q9UL42 364 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 PLAAQ9Y263 795 aa22.03■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 VWA5AO00534 786 aa22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 KIF4AO95239 1232 aa22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 RIPK1Q13546 671 aa22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 SLMAPQ14BN4 828 aa22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 AP1ARQ63HQ0 302 aa22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 HVCN1Q96D96 273 aa22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 SPDL1Q96EA4 605 aa22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HDGFL2-208ENST00000616600 TMEM150BA6NC51 233 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 DLG4P78352 724 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 GTF2BQ00403 316 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 GUCY2DQ02846 1103 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 MICALL2Q8IY33 904 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 WNK4Q96J92 1243 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 CCNE2O96020 404 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 FDX1P10109 184 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 ATG4CQ96DT6 458 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 RIPK3Q9Y572 518 aa22.01■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 BACH1O14867 736 aa22■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 KRT13P13646 458 aa22■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 GUCY2FP51841 1108 aa22■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 GALCP54803 685 aa22■■□□□ 1.11
HDGFL2-208ENST00000616600 PSMC5P62195 406 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms