RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	COQ10A	Q96MF6	247 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FEZ1	Q99689	392 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FANCL	Q9NW38	375 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf78	A6NCI8	922 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	PRL	P01236	227 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	GYPE	P15421	78 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TCIRG1	Q13488	830 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS72	Q15906	364 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	LONRF3	Q496Y0	759 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXB1	Q99853	325 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	BOC	Q9BWV1	1114 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PLD2	O14939	933 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CAND2	O75155	1236 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	FNTB	P49356	437 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC24C	P53992	1094 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	NHLH1	Q02575	133 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR162	Q16538	588 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CALML6	Q8TD86	181 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ST8SIA2	Q92186	375 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PLAA	Q9Y263	795 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	EID1	Q9Y6B2	187 aa		3.65	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	LPXN	O60711	386 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	HIP1R	O75146	1068 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFPL1	O95159	310 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	RAPGEF3	O95398	923 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PTH2R	P49190	550 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	RGS3	P49796	1198 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHB1	P54762	984 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ANTXR2	P58335	489 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SQSTM1	Q13501	440 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	LCORL	Q8N3X6	602 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	NME8	Q8N427	588 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	AHRR	A9YTQ3	701 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ALG1L2	C9J202	215 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R2C6	588 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SH3BP5	O60239	455 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PLIN1	O60240	522 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GNAT2	P19087	354 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCR5	P32302	372 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	IGFALS	P35858	605 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GNAL	P38405	381 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF11	P52732	1056 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC6A3	Q01959	620 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF460	Q14592	562 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	TCEA2	Q15560	299 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CHST14	Q8NCH0	376 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		3.63	□□□□□ -1.83

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