RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555382.5

PRKCH-215, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 3

Gene PRKCH, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-215	ENST00000555382	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	UPP2	O95045	317 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	CTSH	P09668	335 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	LIG1	P18858	919 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	ARL2	P36404	184 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	NPEPPS	P55786	919 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	MCM6	Q14566	821 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	FIBCD1	Q8N539	461 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	EFHB	Q8N7U6	833 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	SUSD6	Q92537	303 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	APBB2	Q92870	758 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	DHX58	Q96C10	678 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PAGE5	Q96GU1	130 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	TRIM9	Q9C026	710 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	SETD4	Q9NVD3	440 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	DACT1	Q9NYF0	836 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	CACNA1B	Q00975	2339 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	CHRNA1	P02708	482 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	GAP43	P17677	238 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	AVPR2	P30518	371 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	EHHADH	Q08426	723 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	MGAT3	Q09327	533 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	GIT2	Q14161	759 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	KCNB1	Q14721	858 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	EMC2	Q15006	297 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	MTERF2	Q49AM1	385 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	RSPH3	Q86UC2	560 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	DDX12P	Q92771	950 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	P2RX5	Q93086	422 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PLVAP	Q9BX97	442 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PANK2	Q9BZ23	570 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	CEP250	Q9BV73	2442 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	TMEM150B	A6NC51	233 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PRR23A	A6NEV1	266 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	MYMK	A6NI61	221 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382		H0YCG3	227 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	DGKI	O75912	1065 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	ITGB1	P05556	798 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	NBL1	P41271	181 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	DPYD	Q12882	1025 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	MAPK7	Q13164	816 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PSMD2	Q13200	908 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	POSTN	Q15063	836 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	ZNF410	Q86VK4	478 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	GPBP1	Q86WP2	473 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	DAW1	Q8N136	415 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	GPT2	Q8TD30	523 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PLIN2	Q99541	437 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	SMC2	O95347	1197 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PLS3	P13797	630 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	NAMPT	P43490	491 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	NDUFV1	P49821	464 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	NUBP1	P53384	320 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	ALCAM	Q13740	583 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	KCNC3	Q14003	757 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	TFDP1	Q14186	410 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	LPIN1	Q14693	890 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	NFKBIB	Q15653	356 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PRKCH-215	ENST00000555382	PTPN21	Q16825	1174 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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