RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548391.1

PRAMENP-203, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,445 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-203ENST00000548391 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM175Q9BSA9 504 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 VN1R3Q9BXE9 311 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 S1PR5Q9H228 398 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 FZD8Q9H461 694 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 KIAA1024Q9UPX6 916 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 IRAK3Q9Y616 596 aa13.09□□□□□ -0.31
PRAMENP-203ENST00000548391 ARL5CA6NH57 179 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 GPR37L1O60883 481 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 CXCL14O95715 111 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 ALDH2P05091 517 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 SRGAP2BP0DMP2 458 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 CTSAP10619 480 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 MLH1P40692 756 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 MCM2P49736 904 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM187BQ17R55 369 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 TMEM31Q5JXX7 168 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 MCTP1Q6DN14 999 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 ANKRD54Q6NXT1 300 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 LLGL2Q6P1M3 1020 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 SLC27A1Q6PCB7 646 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 SYCE2Q6PIF2 218 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 AUTS2Q8WXX7 1259 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PRIMPOLQ96LW4 560 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 ZFP42Q96MM3 310 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 LRFN3Q9BTN0 628 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 RAB34Q9BZG1 259 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 BHMT2Q9H2M3 363 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 MIOSQ9NXC5 875 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 FAN1Q9Y2M0 1017 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 GIT1Q9Y2X7 761 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 STK24Q9Y6E0 443 aa13.08□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 FAM86C2PA6NEL3 165 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 NRP1O14786 923 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 NPTXRO95502 500 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 ALADP13716 330 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PRPHP41219 470 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 DSC1Q08554 894 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 GIT2Q14161 759 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 RILPL1Q5EBL4 403 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 COLGALT2Q8IYK4 626 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 GSTCDQ8NEC7 633 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 CASP10Q92851 521 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 APOL6Q9BWW8 343 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 TTLL13PA6NNM8 815 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PP2D1A8MPX8 630 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 LOC730098B7Z3J9 87 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 H3BQV1 296 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 DCXO43602 365 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 AKAP5P24588 427 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 CDC25AP30304 524 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 CA8P35219 290 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 NAMPTP43490 491 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 SCNN1GP51170 649 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 MAPK6Q16659 721 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 KRT79Q5XKE5 535 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 DTHD1Q6ZMT9 781 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 HACE1Q8IYU2 909 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 CCDC113Q9H0I3 377 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 POLD4Q9HCU8 107 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 MARCH5Q9NX47 278 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 STK39Q9UEW8 545 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 ACKR2O00590 384 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 LILRB3O75022 631 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 EDN1P05305 212 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PPP2R5AQ15172 486 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PTPN14Q15678 1187 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 RNF135Q8IUD6 432 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 KIFAP3Q92845 792 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 DNM3Q9UQ16 869 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 SMC3Q9UQE7 1217 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 E9PMD0 336 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 N4BP3O15049 544 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 EFEMP2O95967 443 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 SOD2P04179 222 aa13.05□□□□□ -0.32
PRAMENP-203ENST00000548391 PRKCBP05771 671 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms