RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524955.1

CHMP4A-202, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 268 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-202ENST00000524955 B4GALT3O60512 393 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 KINO60870 393 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 DGKIO75912 1065 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 BAIAP3O94812 1187 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 POMCP01189 267 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 ITGA4P13612 1032 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 HOXD13P35453 343 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 MLH1P40692 756 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SARSP49591 514 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 LIG4P49917 911 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SCNN1GP51170 649 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 EFNA5P52803 228 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SMTNP53814 917 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 CDC42EP1Q00587 391 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 AMPD3Q01432 767 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 DPYDQ12882 1025 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 STK4Q13043 487 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 GLRA4Q5JXX5 417 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC39A4Q6P5W5 647 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 NOTUMQ6P988 496 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC27A1Q6PCB7 646 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 UNC13DQ70J99 1090 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SLC24A5Q71RS6 500 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 ZNF720Q7Z2F6 126 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SYCP3Q8IZU3 236 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 KIAA0895Q8NCT3 520 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 GPT2Q8TD30 523 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SPIRE2Q8WWL2 714 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 TOP1MTQ969P6 601 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 TIFAQ96CG3 184 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 FAM212AQ96EL1 285 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SAAL1Q96ER3 474 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 EEF2KMTQ96G04 330 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 CASD1Q96PB1 797 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 GBP4Q96PP9 640 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 GAD1Q99259 594 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 TIPINQ9BVW5 301 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 FTHL17Q9BXU8 183 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 C2orf40Q9H1Z8 148 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 MIOSQ9NXC5 875 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SNTG2Q9NY99 539 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 KCND2Q9NZV8 630 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 IPPQ9Y573 584 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 TANC1Q9C0D5 1861 aa5.05□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 A0A0U1RQF3 1178 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 A0A1B0GUA9 196 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 FRMD3A2A2Y4 597 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 LINC01553A4QN01 128 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 ABLIM1O14639 778 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 N4BP3O15049 544 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 OFD1O75665 1012 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 RECQL4O94761 1208 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 DDHD2O94830 711 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 GJB5O95377 273 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 STAG3L1P0CL83 205 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 GAP43P17677 238 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 MCM4P33991 863 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 ACOT2P49753 483 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 CYP2J2P51589 502 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 GUCY2FP51841 1108 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 WNT7BP56706 349 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 BCAR1P56945 870 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 FAM189BP81408 668 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 GTF2BQ00403 316 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 TAP1Q03518 808 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 POU5F1BQ06416 359 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 FAM187BQ17R55 369 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 SCARA3Q6AZY7 606 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.04□□□□□ -1.6
CHMP4A-202ENST00000524955 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa5.04□□□□□ -1.6
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