RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC55Q6ZSA7 311 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ACTRT1Q8TDG2 376 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RMDN2Q96LZ7 410 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CSRNP1Q96S65 589 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 VCXQ9H320 206 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFB10O96000 172 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 GH1P01241 217 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 BRAFP15056 766 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NR2F2P24468 414 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 KLC1Q07866 573 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP44Q17R89 818 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 EXOC3L4Q17RC7 722 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 MIGA2Q7L4E1 593 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 GLYCTKQ8IVS8 523 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PITPNM3Q9BZ71 974 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 BHMT2Q9H2M3 363 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PI4KBQ9UBF8 816 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 NOL4O94818 638 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RCN2Q14257 317 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CATSPER3Q86XQ3 398 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 JAMLQ86YT9 394 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ASIC3Q9UHC3 531 aa17.4■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCA1P28370 1054 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 KCNA1Q09470 495 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO11Q86XK2 927 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 FAM86B1E9PN63 330 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ENTPD5O75356 428 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RAD17O75943 681 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 FAM86B2P0C5J1 330 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 GRIPAP1Q4V328 841 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SLC27A3Q5K4L6 730 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SFR1Q86XK3 245 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TPH2Q8IWU9 490 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SYCE1Q8N0S2 351 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SPIRE2Q8WWL2 714 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TLCD1Q96CP7 247 aa17.39■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CYP11B2P19099 503 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MMP13P45452 471 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM119Q4V9L6 283 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 GBP5Q96PP8 586 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ERVK-5Q9HDB9 667 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MAST2Q6P0Q8 1798 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 GALCP54803 685 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CNGA2Q16280 664 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SCFD1Q8WVM8 642 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MASTLQ96GX5 879 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 AMNQ9BXJ7 453 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MEIS2O14770 477 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 GCNT3O95395 438 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 AGTP01019 485 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MYBP10242 640 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC9Q8WXX5 260 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SYT15Q9BQS2 421 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 HDAC9Q9UKV0 1011 aa17.38■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 hCG_1984214I3L0E3 225 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SIAH1Q8IUQ4 282 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RDH13Q8NBN7 331 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 TTC8Q8TAM2 541 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SCOCQ9UIL1 159 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 AHCYL1O43865 530 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ANO7Q6IWH7 933 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 HHIPL2Q6UWX4 724 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ACER1Q8TDN7 264 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 FGD4Q96M96 766 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 NT5C3AQ9H0P0 336 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 DNM3Q9UQ16 869 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 H0YIN7 160 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SPAG7O75391 227 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 UCHL3P15374 230 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CDAN1Q8IWY9 1227 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 REEP2Q9BRK0 252 aa17.37■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MAP3K13O43283 966 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 LRRN2O75325 713 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINB4P48594 390 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 MESDQ14696 234 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 ARSHQ5FYA8 562 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35G2Q8TBE7 412 aa17.36■□□□□ 0.37
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC17Q96LX7 622 aa17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms