RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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SNHG12-201ENST00000461448 NELFCDQ8IXH7 590 aa21.44■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ADSSL1Q8N142 457 aa21.44■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ADAM2Q99965 735 aa21.44■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 CHST12Q9NRB3 414 aa21.44■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.44■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 MGEA5O60502 916 aa21.43■■□□□ 1.02
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SNHG12-201ENST00000461448 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 NOTUMQ6P988 496 aa21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 LIG4P49917 911 aa21.42■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF445P59923 1031 aa21.42■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 DSC3Q14574 896 aa21.42■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.42■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM240Q5SV17 173 aa21.42■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.42■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.42■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.026e-9■■■□□ 18.1
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SNHG12-201ENST00000461448 BICDL2A1A5D9 508 aa21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 N4BP3O15049 544 aa21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 HS2ST1Q7LGA3 356 aa21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 TCHPQ9BT92 498 aa21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 GBP3Q9H0R5 595 aa21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.41■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 A0A1B0GUA9 196 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ZBBXA8MT70 800 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ENPP3O14638 875 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ZPBP2Q6X784 338 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC51Q96ER9 411 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 TSG101Q99816 390 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 RGS18Q9NS28 235 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD63C9JTQ0 380 aa21.4■■□□□ 1.02
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SNHG12-201ENST00000461448 HOXD13P35453 343 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 PAK1Q13153 545 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB33Q86T24 672 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ADPGKQ9BRR6 497 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.4■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 TET1Q8NFU7 2136 aa21.39■■□□□ 1.02
SNHG12-201ENST00000461448 TOM1L1O75674 476 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 BAIAP3O94812 1187 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 NPTXRO95502 500 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 CCNE1P24864 410 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 LRRC63Q05C16 580 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 CENPPQ6IPU0 288 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 P2RX5Q93086 422 aa21.39■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 GDF15Q99988 308 aa21.39■■□□□ 1.01
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SNHG12-201ENST00000461448 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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SNHG12-201ENST00000461448 TISP43B9A030 160 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 CLDN3O15551 220 aa21.38■■□□□ 1.01
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SNHG12-201ENST00000461448 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 UBXN11Q5T124 520 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 SLC24A5Q71RS6 500 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 NELFBQ8WX92 580 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 TSPY26PQ9H489 355 aa21.38■■□□□ 1.01
SNHG12-201ENST00000461448 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.38■■□□□ 1.01
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