RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSCBQ8IWL3 235 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BSNDQ8WZ55 320 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPS6KC1Q96S38 1066 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TIPINQ9BVW5 301 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STK39Q9UEW8 545 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PARP2Q9UGN5 583 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GIT1Q9Y2X7 761 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HES2Q9Y543 173 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa17.92■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 K7ERI5 159 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PER2O15055 1255 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC01565O15544 149 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GALTP07902 379 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAM15Q13444 863 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM187BQ17R55 369 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GAD1Q99259 594 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLIN2Q99541 437 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM175Q9BSA9 504 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FZD8Q9H461 694 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNG1Q9UIX4 513 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD207Q9UJ71 328 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAN1Q9Y2M0 1017 aa17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRXCR2A6NFK2 248 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARL5CA6NH57 179 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACKR2O00590 384 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FSCN2O14926 492 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC26A4O43511 780 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIP1RO75146 1068 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBX10O75333 385 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL9P15248 144 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SYT1P21579 422 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LONP1P36776 959 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR1G1P47890 313 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC11A1P49279 550 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PEX3P56589 373 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DUSP6Q16828 381 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF280BQ86YH2 543 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VPS52Q8N1B4 723 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGSF21Q96ID5 467 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLD4Q9HCU8 107 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DNAJB4Q9UDY4 337 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa17.9■□□□□ 0.46
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AKAP5P24588 427 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LTBRP36941 435 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SCNN1GP51170 649 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GIT2Q14161 759 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HYIQ5T013 277 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RINT1Q6NUQ1 792 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RUSC1Q9BVN2 902 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C17orf75Q9HAS0 396 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KMT5AQ9NQR1 393 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCND2Q9NZV8 630 aa17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDHD2O94830 711 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CXCL14O95715 111 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLA2G4BP0C869 781 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GUCY2CP25092 1073 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TXLNAP40222 546 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMTNP53814 917 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LLGL2Q6P1M3 1020 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNK18Q7Z418 384 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZFP42Q96MM3 310 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PNMA5Q96PV4 448 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC113Q9H0I3 377 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF39Q9H2S5 420 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PDZD7Q9H5P4 517 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KLK14Q9P0G3 267 aa17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIDE1A8MVS5 230 aa17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NRP1O14786 923 aa17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STX6O43752 255 aa17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT18P05783 430 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPTX2P47972 431 aa17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRIK3Q13003 919 aa17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STRN3Q13033 797 aa17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATF7IP2Q5U623 682 aa17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C1orf186Q6ZWK4 172 aa17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM178BQ8IXR5 827 aa17.87■□□□□ 0.45
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.4 ms