RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.76e-6■■□□□ 11.7
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PDCL-201ENST00000259467 TBC1D22BQ9NU19 505 aa10.67□□□□□ -0.7
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PDCL-201ENST00000259467 CCPG1Q9ULG6 757 aa10.67□□□□□ -0.7
PDCL-201ENST00000259467 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
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PDCL-201ENST00000259467 CCDC188H7C350 402 aa10.67□□□□□ -0.7
PDCL-201ENST00000259467 RAD51CO43502 376 aa10.67□□□□□ -0.7
PDCL-201ENST00000259467 ERLIN2O94905 339 aa10.67□□□□□ -0.7
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PDCL-201ENST00000259467 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.67□□□□□ -0.7
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PDCL-201ENST00000259467 MIER3Q7Z3K6 550 aa10.67□□□□□ -0.7
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PDCL-201ENST00000259467 KRT12Q99456 494 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDCL-201ENST00000259467 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa10.66□□□□□ -0.7
PDCL-201ENST00000259467 DOCK5Q9H7D0 1870 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDCL-201ENST00000259467 GOLGA6DP0CG33 693 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDCL-201ENST00000259467 TRIM49CP0CI26 452 aa10.66□□□□□ -0.7
PDCL-201ENST00000259467 FDX1P10109 184 aa10.66□□□□□ -0.7
PDCL-201ENST00000259467 ALAS1P13196 640 aa10.66□□□□□ -0.7
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PDCL-201ENST00000259467 K7ENM7 598 aa10.65□□□□□ -0.71
PDCL-201ENST00000259467 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
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