RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 NDUFA10O95299 355 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ZNF131P52739 623 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 LRRC63Q05C16 580 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MIIPQ5JXC2 388 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 IQCDQ96DY2 449 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 DRC1Q96MC2 740 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ERGIC2Q96RQ1 377 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.81■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 GAP43P17677 238 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 KLRC1P26715 233 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ZNF333Q96JL9 665 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 CHP1Q99653 195 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 CTAGE9A4FU28 777 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 C22orf31O95567 290 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP25P42331 645 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ACLYP53396 1101 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MEA1Q16626 185 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 FIGNQ5HY92 759 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ODR4Q5SWX8 454 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MARCH8Q5T0T0 291 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 LRRC71Q8N4P6 559 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 KIFAP3Q92845 792 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.8■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 NRCAMQ92823 1304 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 A0A1W2PQJ5 194 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ZBED6P86452 979 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 DRP2Q13474 957 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MTHFD1LQ6UB35 978 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 METTL13Q8N6R0 699 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 C7orf31Q8N865 590 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 TSG101Q99816 390 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.79■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MAGEB2O15479 319 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 PLS3P13797 630 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 CLCN6P51797 869 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 HIC1Q14526 733 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 WDR59Q6PJI9 974 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 SLC35F6Q8N357 371 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ARMC5Q96C12 935 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ARL2P36404 184 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 PEX3P56589 373 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 BSNDQ8WZ55 320 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA1Q92805 767 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 SEL1LQ9UBV2 794 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 CDC23Q9UJX2 597 aa21.78■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 CLCN3P51790 818 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 VWA3BQ502W6 1294 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 IER5Q5VY09 327 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 FIZ1Q96SL8 496 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 ZNF446Q9NWS9 450 aa21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CLN8-208ENST00000635751 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 CASP5P51878 434 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 KRT83P78385 493 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 MAN2A1Q16706 1144 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 CEP112Q8N8E3 955 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 ASAP3Q8TDY4 903 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 TCP11Q8WWU5 503 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 RABGGTAQ92696 567 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.76■■□□□ 1.07
CLN8-208ENST00000635751 GRIN2DO15399 1336 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms