RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 ALCAMQ13740 583 aa20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM187BQ17R55 369 aa20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PADI3Q9ULW8 664 aa20.52■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYCE3A1L190 88 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACKR2O00590 384 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSPAN1O60635 241 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 CD44P16070 742 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 STRN3Q13033 797 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 MFSD5Q6N075 450 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP38Q8NB14 1042 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 HVCN1Q96D96 273 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 VWCEQ96DN2 955 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACCSQ96QU6 501 aa20.51■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 LTBP2Q14767 1821 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPR182O15218 404 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 CAPN15O75808 1086 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ERLIN2O94905 339 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 CSF2RAP15509 400 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCP2P22307 547 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 NLRP12P59046 1061 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAK2Q13177 524 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 CPB2Q96IY4 423 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBE4BO95155 1302 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 CXCL10P02778 98 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABCD1P33897 745 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 DPCR1Q3MIW9 517 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADSSL1Q8N142 457 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 BADQ92934 168 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 BICD1Q96G01 975 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa20.49■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TISP43B9A030 160 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCTN1Q2MV58 587 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYCP3Q8IZU3 236 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM199Q8N511 208 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMX1Q9H3N1 280 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM206Q9H813 350 aa20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 PIGRP01833 764 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 RFC2P35250 354 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TYRO3Q06418 890 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.47■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TGFB1I1O43294 461 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 MGEA5O60502 916 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 LIG4P49917 911 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZPBP2Q6X784 338 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 MLKLQ8NB16 471 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 GBP3Q9H0R5 595 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.46■□□□□ 0.87
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1B0GUA9 196 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF20AO95235 890 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 ACRP10323 421 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 AXLP30530 894 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 RGS19P49795 217 aa20.45■□□□□ 0.86
USP3-AS1-203ENST00000559737 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms