RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550724.2

HECTD4-212, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 3

Gene HECTD4, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-212ENST00000550724 ADAM15Q13444 863 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NOTUMQ6P988 496 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 DTHD1Q6ZMT9 781 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 RSAD1Q9HA92 442 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 FAM50BQ9Y247 325 aa16.04■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TBX10O75333 385 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 POMCP01189 267 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CYP11B2P19099 503 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CDC25AP30304 524 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 AXLP30530 894 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 RBM10P98175 930 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 IL17AQ16552 155 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 RILPL1Q5EBL4 403 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 KRT79Q5XKE5 535 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 EFHBQ8N7U6 833 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM169Q96HH4 297 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CD207Q9UJ71 328 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 LZTS1Q9Y250 596 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 HES2Q9Y543 173 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 IPPQ9Y573 584 aa16.03■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 HIDE1A8MVS5 230 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 LAD1O00515 517 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 FSCN2O14926 492 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 NPTXRO95502 500 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 POU5F1BQ06416 359 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PDIA5Q14554 519 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 COL19A1Q14993 1142 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 ZNF280BQ86YH2 543 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CNNM3Q8NE01 707 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 DEPTORQ8TB45 409 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CCDC51Q96ER9 411 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 CSRNP2Q9H175 543 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 RNF39Q9H2S5 420 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 DNAJB4Q9UDY4 337 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 STK24Q9Y6E0 443 aa16.02■□□□□ 0.16
HECTD4-212ENST00000550724 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 E9PMD0 336 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 NCLP19338 710 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 MUTP22033 750 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 SLC11A1P49279 550 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 AMHR2Q16671 573 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 IGSF22Q8N9C0 903 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 BSNDQ8WZ55 320 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 IFT74Q96LB3 600 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 PLIN2Q99541 437 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 BACH2Q9BYV9 841 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 DNM3Q9UQ16 869 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 USP20Q9Y2K6 914 aa16.01■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 VWA3AA6NCI4 1184 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 MBTPS2O43462 519 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 DDHD2O94830 711 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 CXCL14O95715 111 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 GALTP07902 379 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 AKAP5P24588 427 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 MLH1P40692 756 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 PRPHP41219 470 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 DUSP6Q16828 381 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 HACE1Q8IYU2 909 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 GJD3Q8N144 294 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 VPS52Q8N1B4 723 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 RSPH1Q8WYR4 309 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 GAD1Q99259 594 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 KIFC3Q9BVG8 833 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 APOL5Q9BWW9 433 aa16■□□□□ 0.15
HECTD4-212ENST00000550724 NFKBIZQ9BYH8 718 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms