RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PHKG2	P15735	406 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF20	P17024	532 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	HERVK_113	P62684	666 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	NME9	Q86XW9	330 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MIB1	Q86YT6	1006 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	LGI4	Q8N135	537 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MIER2	Q8N344	545 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	KY	Q8NBH2	561 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	BTBD7	Q9P203	1132 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SOGA1	O94964	1423 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PMM2	O15305	246 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	CREB3	O43889	395 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PRL	P01236	227 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	FAH	P16930	419 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	RHCE	P18577	417 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	AOAH	P28039	575 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINB3	P29508	390 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	RHD	Q02161	417 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PICALM	Q13492	652 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MORC3	Q14149	939 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MUM1	Q2TAK8	710 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC38	Q5R3I4	469 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PPM1N	Q8N819	430 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TTLL6	Q8N841	843 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC17	Q96AE7	1141 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	COA7	Q96BR5	231 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	DPP7	Q9UHL4	492 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ASB1	Q9Y576	335 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MROH6	A6NGR9	719 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TPP1	O14773	563 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	APOL3	O95236	402 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MPIG6B	O95866	241 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PDC	P20941	246 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MC4R	P32245	332 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	LGALS4	P56470	323 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	BORA	Q6PGQ7	559 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PRR18	Q8N4B5	295 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	HIPK4	Q8NE63	616 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	FERMT2	Q96AC1	680 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	EVI5L	Q96CN4	794 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	RAX2	Q96IS3	184 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MAML3	Q96JK9	1138 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PFKM	P08237	780 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MTHFD2	P13995	350 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	EDNRB	P24530	442 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	HTR3A	P46098	478 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS3	P49796	1198 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC5A3	P53794	718 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGA1	P56199	1179 aa		5.16	□□□□□ -1.58

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