RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492460.5

CACNA2D3-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

TSL 4

Gene CACNA2D3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-211ENST00000492460 ZNF568Q3ZCX4 644 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 LIMS2Q7Z4I7 341 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 PJA1Q8NG27 643 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ACAP3Q96P50 834 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 LRRC37BQ96QE4 947 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ANO3Q9BYT9 981 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 MEGF9Q9H1U4 602 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 KCMF1Q9P0J7 381 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 NR2E1Q9Y466 385 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa5.06□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ANO9A1A5B4 782 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 GOLGA8AA7E2F4 631 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 GOLGA8BA8MQT2 603 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 OPHN1O60890 802 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 FOSP01100 380 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 EPHB4P54760 987 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 BCAR1P56945 870 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 MORC3Q14149 939 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ACAP2Q15057 778 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 SURF1Q15526 300 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 FRMD7Q6ZUT3 714 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CXorf38Q8TB03 319 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 IL17RAQ96F46 866 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 SLC39A13Q96H72 371 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 DYDC2Q96IM9 177 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 LRGUKQ96M69 825 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 UBA5Q9GZZ9 404 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CSRNP2Q9H175 543 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CHST12Q9NRB3 414 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.05□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 MYPNQ86TC9 1320 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 A0A0A6YYJ9 748 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 PRSS38A1L453 326 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ARHGAP6O43182 974 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 OFD1O75665 1012 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 AKAP5P24588 427 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 PLP2Q04941 152 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ACAP1Q15027 740 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 PDCD1Q15116 288 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CCDC62Q6P9F0 684 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 USP30Q70CQ3 517 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CMIPQ8IY22 773 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 TIFAQ96CG3 184 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 GNRHR2Q96P88 292 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 LMF1Q96S06 567 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 OR10A2Q9H208 303 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 USP18Q9UMW8 372 aa5.04□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 MATN2O00339 956 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 GPR42O15529 346 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ITGB3P05106 788 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 PFKMP08237 780 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CELA3BP08861 270 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 SYN1P17600 705 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 RAC3P60763 192 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CT83Q5H943 113 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 GLB1LQ6UWU2 654 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 MIER2Q8N344 545 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 LMBR1Q8WVP7 490 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 CFHR4Q92496 578 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 TEKT5Q96M29 485 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 WDR92Q96MX6 357 aa5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
CACNA2D3-211ENST00000492460 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms