RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 YAF2Q8IY57 180 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 APBA1Q02410 837 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 AK9Q5TCS8 1911 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ITIH6Q6UXX5 1313 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 KIF3CO14782 793 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PPP2R5CQ13362 524 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 LAMC2Q13753 1193 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 SLIT3O75094 1523 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ATP1A2P50993 1020 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 CCNYQ8ND76 341 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 MROH8Q9H579 483 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 CSPG5O95196 566 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 KRT1P04264 644 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 NR3C2P08235 984 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 AKAP12Q02952 1782 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RDM1Q8NG50 284 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PALMO75781 387 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 SKIP12755 728 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 TC2NQ8N9U0 490 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 AAASQ9NRG9 546 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 SRGAP2O75044 1071 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 DGKDQ16760 1214 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 KAZNQ674X7 775 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 KCND2Q9NZV8 630 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PEAK1Q9H792 1746 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 HIP1RO75146 1068 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RNF40O75150 1001 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 CALB1P05937 261 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 VAMP7P51809 220 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ASPHQ12797 758 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 TNIP3Q96KP6 325 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 CPB1P15086 417 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 KCTD6Q8NC69 237 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 GBP5Q96PP8 586 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 CHP1Q99653 195 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ABCB6Q9NP58 842 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 CA4P22748 312 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ACAP3Q96P50 834 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 WDR24Q96S15 920 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 REEP2Q9BRK0 252 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.55□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 HOXC6P09630 235 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RALAP11233 206 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RPS6KA2Q15349 733 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 STAG3L1P0CL83 205 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 TRIM4Q9C037 500 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 RPA1P27694 616 aa14.54□□□□□ -0.08
NISCH-207ENST00000479054 PDXDC1Q6P996 788 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms