RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476089.1

ITGA4-207, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA4, Length 1,846 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-207ENST00000476089 SPAG5Q96R06 1193 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 DEF6Q9H4E7 631 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 UCHL3P15374 230 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 TNFAIP2Q03169 654 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 GRM1Q13255 1194 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 CRHR2Q13324 411 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.31■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 KIF3CO14782 793 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 APBA1Q02410 837 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 DRP2Q13474 957 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.3■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 GPD1LQ8N335 351 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 P4HA2O15460 535 aa22.29■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 CYP2B6P20813 491 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 TERF1P54274 439 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 TFDP1Q14186 410 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 SPA17Q15506 151 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 DGKDQ16760 1214 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 CBWD6Q4V339 395 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 METTL13Q8N6R0 699 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 FBXL18Q96ME1 805 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 MYO6Q9UM54 1294 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 CA12O43570 354 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 SERPING1P05155 500 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 INSRRP14616 1297 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 DLG4P78352 724 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 USP6NLQ92738 828 aa22.29■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.29■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 H3BRB1 525 aa22.28■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 ASAP2O43150 1006 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 MMP3P08254 477 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF286BP0CG31 522 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 RNF149Q8NC42 400 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 APBA2Q99767 749 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.28■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.28■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 ZNF233A6NK53 670 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 AKR1B10O60218 316 aa22.27■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 KIAA1328Q86T90 577 aa22.27■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.27■■□□□ 1.16
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ITGA4-207ENST00000476089 DNAI1Q9UI46 699 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 COL1A2P08123 1366 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 SIP14410 1827 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA4-207ENST00000476089 EXTL3O43909 919 aa22.27■■□□□ 1.15
ITGA4-207ENST00000476089 KIF5CO60282 957 aa22.27■■□□□ 1.15
ITGA4-207ENST00000476089 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
ITGA4-207ENST00000476089 ALDH1A1P00352 501 aa22.27■■□□□ 1.15
ITGA4-207ENST00000476089 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
ITGA4-207ENST00000476089 GCLMP48507 274 aa22.27■■□□□ 1.15
ITGA4-207ENST00000476089 GNG11P61952 73 aa22.27■■□□□ 1.15
ITGA4-207ENST00000476089 ENPEPQ07075 957 aa22.27■■□□□ 1.15
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