RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB17Q9H0T7 212 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 RASSF4Q9H2L5 321 aa24.96■■□□□ 1.59
RABGGTA-202ENST00000399409 GCLMP48507 274 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CEP85LQ5SZL2 805 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CPXCR1Q8N123 301 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 BCAS4Q8TDM0 211 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 NR1D1P20393 614 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 MXI1P50539 228 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC20A1Q8WUM9 679 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.95■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 TISP43B9A030 160 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 WNT10BO00744 389 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 TTI1O43156 1089 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 DAPK3O43293 454 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 RTN2O75298 545 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 HSPA6P17066 643 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CORO7P57737 925 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 GPC5P78333 572 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT76Q01546 638 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 PGM5Q15124 567 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 DCAF12L1Q5VU92 463 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 PALB2Q86YC2 1186 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 MORC4Q8TE76 937 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 COG5Q9UP83 839 aa24.94■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM187AA6NFU0 413 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 WDR64B1ANS9 1081 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 EBAG9O00559 213 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 MYZAPP0CAP1 466 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 UBL4BQ8N7F7 174 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 RDM1Q8NG50 284 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 H0YGN5 161 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 BACH1O14867 736 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 ZEB2O60315 1214 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 FDX1P10109 184 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 GZMAP12544 262 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 SPP2Q13103 211 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 SPDYCQ5MJ68 293 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM117Q9H0C3 514 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 NFS1Q9Y697 457 aa24.93■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC16A4O15374 487 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 MTA2O94776 668 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 SMTNP53814 917 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 PEX3P56589 373 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 BIRC3Q13489 604 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 XRRA1Q6P2D8 792 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM71AQ8IYT1 594 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 ALG6Q9Y672 507 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 ZBED4O75132 1171 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CCT5P48643 541 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 MFAP3P55082 362 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 PDCLQ13371 301 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 C10orf67Q8IYJ2 551 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 PLEKHO2Q8TD55 490 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa24.92■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 RASA3Q14644 834 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 UGCGQ16739 394 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 XKR9Q5GH70 373 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP1A2P50993 1020 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 DR1Q01658 176 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CXCL9Q07325 125 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC20A2Q08357 652 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 TNFAIP1Q13829 316 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 FAM102BQ5T8I3 360 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.91■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 VCAM1P19320 739 aa24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 MAGEA9P43362 315 aa24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 RMDN3Q96TC7 470 aa24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 PXMP2Q9NR77 195 aa24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 TBX20Q9UMR3 447 aa24.9■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM66O15016 1216 aa24.89■■□□□ 1.58
RABGGTA-202ENST00000399409 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms