RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.46■■□□□ 1.19
SMURF1-201ENST00000361125 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.46■■□□□ 1.19
SMURF1-201ENST00000361125 KIF12Q96FN5 646 aa22.46■■□□□ 1.19
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.46■■□□□ 1.19
SMURF1-201ENST00000361125 CTDNEP1O95476 244 aa22.46■■□□□ 1.19
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SMURF1-201ENST00000361125 CYP26A1O43174 497 aa22.44■■□□□ 1.18
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SMURF1-201ENST00000361125 TTI1O43156 1089 aa22.43■■□□□ 1.18
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SMURF1-201ENST00000361125 PDHBP11177 359 aa22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 NR1I3Q14994 352 aa22.42■■□□□ 1.18
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SMURF1-201ENST00000361125 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
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SMURF1-201ENST00000361125 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 GNGT2O14610 69 aa22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 PAMP19021 973 aa22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SMURF1-201ENST00000361125 INTUQ9ULD6 942 aa22.42■■□□□ 1.18
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