RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356489.9

BCKDHB-202, Transcript of branched chain keto acid dehydrogenase E1 subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDHB, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHB-202ENST00000356489 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 MAPK6Q16659 721 aa26■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 CATSPER4Q7RTX7 472 aa26■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 GSDMAQ96QA5 445 aa26■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 TTC3P53804 2025 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 TTLL13PA6NNM8 815 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 B4GALT5O43286 388 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 MYBP10242 640 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 SCP2P22307 547 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 NFKBIBQ15653 356 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 SEPT8Q92599 483 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 APBB2Q92870 758 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 SMARCE1Q969G3 411 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.99■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 ACKR2O00590 384 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 ERLIN2O94905 339 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 SMC2O95347 1197 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 GCNT3O95395 438 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 STK4Q13043 487 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 TBX20Q9UMR3 447 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 USP20Q9Y2K6 914 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 PSMD2Q13200 908 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.98■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 MGEA5O60502 916 aa25.97■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 KCNA1Q09470 495 aa25.97■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.97■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 MAP4K3Q8IVH8 894 aa25.97■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 LINC01599Q8WXQ3 324 aa25.97■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 HVCN1Q96D96 273 aa25.97■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 ABCD1P33897 745 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 ALCAMQ13740 583 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 DSC3Q14574 896 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 TMEM240Q5SV17 173 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 CPB2Q96IY4 423 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 GDF15Q99988 308 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 FTHL17Q9BXU8 183 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 RMND1Q9NWS8 449 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 MAN1B1Q9UKM7 699 aa25.96■■□□□ 1.75
BCKDHB-202ENST00000356489 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 AXLP30530 894 aa25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 STRN3Q13033 797 aa25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF365Q70YC5 407 aa25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 CHST12Q9NRB3 414 aa25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 GDAQ9Y2T3 454 aa25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.95■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 A0A1B0GUA9 196 aa25.94■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 HOXD13P35453 343 aa25.94■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.94■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 BMT2Q1RMZ1 405 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 ADAM2Q99965 735 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 IKZF4Q9H2S9 585 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 TRIP11Q15643 1979 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 UBE4BO95155 1302 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 PIGRP01833 764 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 FGBP02675 491 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 BMP6P22004 513 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 MORC3Q14149 939 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 IKBKEQ14164 716 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 NOTUMQ6P988 496 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 PDZD7Q9H5P4 517 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 CITO14578 2027 aa25.93■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 LAMA3Q16787 3333 aa25.92■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 BAIAP3O94812 1187 aa25.92■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 ATF7IP2Q5U623 682 aa25.92■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 ISM2Q6H9L7 571 aa25.92■■□□□ 1.74
BCKDHB-202ENST00000356489 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms