RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB129Q9H1M3 183 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 IRF6O14896 467 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 USP8P40818 1118 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 QARSP47897 775 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 MTMR1Q13613 665 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 KIF22Q14807 665 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CEP85LQ5SZL2 805 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 AADACL2Q6P093 401 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 HAUS6Q7Z4H7 955 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 BCAS4Q8TDM0 211 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ELMO3Q96BJ8 720 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 HSPBP1Q9NZL4 362 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.7■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 BACH1O14867 736 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PLS3P13797 630 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 YWHABP31946 246 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PEX3P56589 373 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PLA2G4FQ68DD2 849 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM31Q9BZY9 425 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 DPH5Q9H2P9 285 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC188H7C350 402 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 SKOR1P84550 965 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CUL1Q13616 776 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 RPAINQ86UA6 219 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 FAM83AQ86UY5 434 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 RTKN2Q8IZC4 609 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 NEK9Q8TD19 979 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ALG3Q92685 438 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ACCSQ96QU6 501 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM51Q9BSJ1 452 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 KIFC3Q9BVG8 833 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CENPHQ9H3R5 247 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 EGFRP00533 1210 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 RPS6P62753 249 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM206Q9H813 350 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ERVK-5Q9HDB9 667 aa17.69■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD62A6NC57 917 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ZEB2O60315 1214 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 FTLP02792 175 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 GUCY1A3Q02108 690 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 RASA3Q14644 834 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 TNIP1Q15025 636 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 FKBP1CQ5VVH2 108 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PCNX4Q63HM2 1172 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CD302Q8IX05 232 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PSMD1Q99460 953 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ADRB2P07550 413 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 DPEP1P16444 411 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 SCP2P22307 547 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CXCL9Q07325 125 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 EPC2Q52LR7 807 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 XXYLT1Q8NBI6 393 aa17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 SGPL1O95470 568 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CCNE2O96020 404 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 KCNA3P22001 575 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CEP89Q96ST8 783 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHB18PQ96TA0 734 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM117Q9H0C3 514 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ALG6Q9Y672 507 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 H0YGN5 161 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 MARCKSL1P49006 195 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 SOX10P56693 466 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 MYBPC2Q14324 1141 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 FAM102BQ5T8I3 360 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CBWD2Q8IUF1 395 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 SAAL1Q96ER3 474 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 NFS1Q9Y697 457 aa17.67■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD63C9JTQ0 380 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 MAP3K10Q02779 954 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 PGM5Q15124 567 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 KRT35Q92764 455 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 GLG1Q92896 1179 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC127Q96BQ5 260 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 WNK4Q96J92 1243 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 NR1D1P20393 614 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 ADSSP30520 456 aa17.66■□□□□ 0.42
SHQ1-201ENST00000325599 GTF2BQ00403 316 aa17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms