RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 AMACRQ9UHK6 382 aa20.97■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.97■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.97■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF536O15090 1300 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 ANP32DO95626 131 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 SLC5A5Q92911 643 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 WNK4Q96J92 1243 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 LXNQ9BS40 222 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 SIX2Q9NPC8 291 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 CCT8L1PA6NM43 557 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 DAPK3O43293 454 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 ITGA4P13612 1032 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 INHBEP58166 350 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC45Q96CN5 670 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.96■□□□□ 0.95
ZNF554-201ENST00000317243 KRIT1O00522 736 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 EPHA7Q15375 998 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 KRT71Q3SY84 523 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC63Q8NA47 563 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 GCNT4Q9P109 453 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 GNA14O95837 355 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 GHRP10912 638 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PRELPP51888 382 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 DPH5Q9H2P9 285 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 EBF2Q9HAK2 575 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 MYH11P35749 1972 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PDXKO00764 312 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PAEPP09466 180 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 SPP2Q13103 211 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 METTL13Q8N6R0 699 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ALAS1P13196 640 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 RASA3Q14644 834 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CBWD6Q4V339 395 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 DAW1Q8N136 415 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.94■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PPP2R5CQ13362 524 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CUL1Q13616 776 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ODR4Q5SWX8 454 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 P3H4Q92791 437 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 SORBS3O60504 671 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PEX26Q7Z412 305 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 SCFD2Q8WU76 684 aa20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.93■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 TTI1O43156 1089 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 GFPT2O94808 682 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 AGBL2Q5U5Z8 902 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PARVGQ9HBI0 331 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 NAGPAQ9UK23 515 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 TRPC6Q9Y210 931 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PSME4Q14997 1843 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 CENPFP49454 3210 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ENO4A6NNW6 628 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 AGAP11Q8TF27 550 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 BORCS6Q96GS4 357 aa20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ZNF554-201ENST00000317243 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms