RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 MYH10P35580 1976 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SIPA1L1O43166 1804 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 F8VZ95 297 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 EXOC3L1Q86VI1 746 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CCDC28BQ9BUN5 200 aa23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 GJB6O95452 261 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 INF2Q27J81 1249 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 NOX5Q96PH1 765 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SPATA16Q9BXB7 569 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 FAM114A2Q9NRY5 505 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa23.56■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PQJ5 194 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CETN3O15182 167 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 GGT7Q9UJ14 662 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 TRIM33Q9UPN9 1127 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 NAPAP54920 295 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 TMC3Q7Z5M5 1100 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SELENOSQ9BQE4 189 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 MRIQ9BWK5 157 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 PNMA3Q9UL41 463 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.55■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SIGLEC16A6NMB1 481 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 TJP3O95049 919 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 HLA-DOAP06340 250 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SNHG28P0DPA3 235 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SKIP12755 728 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 RASIP1Q5U651 963 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 NUDCD1Q96RS6 583 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 TTLL1O95922 423 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 LMNB1P20700 586 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SULT2A1Q06520 285 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CCDC15Q0P6D6 951 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 FIGNQ5HY92 759 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CCNJLQ8IV13 435 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 GATA6Q92908 595 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 CORO1BQ9BR76 489 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 MIS12Q9H081 205 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 NEUROG2Q9H2A3 272 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 UNC5CO95185 931 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 RCN2Q14257 317 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 WASHC2DQ5SRD0 308 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 USP38Q8NB14 1042 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 ZNF653Q96CK0 615 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 PGM2Q96G03 612 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 HIC2Q96JB3 615 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 BRD8Q9H0E9 1235 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 GNA14O95837 355 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 KIF11P52732 1056 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.53■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 PSME4Q14997 1843 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SMCO2A6NFE2 343 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 IDO1P14902 403 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SMARCA1P28370 1054 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 FITM2Q8N6M3 262 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 EXOC1Q9NV70 894 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 NMRK1Q9NWW6 199 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 LMNAP02545 664 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 VHLP40337 213 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 STAMQ92783 540 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 GMLQ99445 158 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 IDI2Q9BXS1 227 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 RNF181Q9P0P0 153 aa23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PITX1-201ENST00000265340 FZD9O00144 591 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 OCRLQ01968 901 aa23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms