RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 SLC9A1P19634 815 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF449Q6P9G9 518 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 OR6B3Q8NGW1 331 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 FAF2Q96CS3 445 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 KLC2Q9H0B6 622 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 FAM47EQ6ZV65 393 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 CFAP36Q96G28 342 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 NBPF3Q9H094 633 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 PRR12Q9ULL5 1215 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 FHOD1Q9Y613 1164 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 UBE4BO95155 1302 aa18.8■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 CYP26A1O43174 497 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 OPHN1O60890 802 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 TOM1L1O75674 476 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 CYP2C19P33261 490 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 MMEL1Q495T6 779 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 TIPINQ9BVW5 301 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 IP6K2Q9UHH9 426 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 OATP04181 439 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 ASNSD1Q9NWL6 643 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 KCND2Q9NZV8 630 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 VPS72Q15906 364 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.79■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA8OA6NCC3 632 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA8NF8WBI6 632 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 DCTN3O75935 186 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 NCAPHQ15003 741 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 ATG16L1Q676U5 607 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 METTL23Q86XA0 190 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 ACAD9Q9H845 621 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 PPP1R37O75864 691 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 KRT7P08729 469 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 KLK7P49862 253 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 Q3C1V9 767 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 MEGF6O75095 1541 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 TNFAIP2Q03169 654 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 GPR162Q16538 588 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 KCTD17Q8N5Z5 321 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 MYBP10242 640 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 SCP2P22307 547 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 FBXO41Q8TF61 875 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM55Q9BYV6 548 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 HSPBP1Q9NZL4 362 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 MROH2AA6NES4 1674 aa18.78■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 KLRK1P26718 216 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 PHKA2P46019 1235 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 BBS5Q8N3I7 341 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf54Q8WWF1 131 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 CHMP6Q96FZ7 201 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 USH1CQ9Y6N9 552 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 DEPDC5O75140 1603 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 E2F4Q16254 413 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 MKNK1Q9BUB5 465 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 MID2Q9UJV3 735 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 GPC3P51654 580 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 NBPF9Q3BBW0 867 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 TTC17Q96AE7 1141 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 SNF8Q96H20 258 aa18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
SCARB2-201ENST00000264896 COPEO14579 308 aa18.77■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 CHUKO15111 745 aa18.77■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 KRT38O76015 456 aa18.77■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 KLRC1P26715 233 aa18.77■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 ANKS1AQ92625 1134 aa18.77■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 KBTBD4Q9NVX7 518 aa18.77■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 UVRAGQ9P2Y5 699 aa18.77■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 ERVK-24P63145 666 aa18.76■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 GUCY1A3Q02108 690 aa18.76■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.76■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 MLXIPLQ9NP71 852 aa18.76■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 TTI1O43156 1089 aa18.76■□□□□ 0.59
SCARB2-201ENST00000264896 KRT14P02533 472 aa18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms