RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L15C9J2P7 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L13C9JLJ4 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L11C9JVI0 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L18D6R9N7 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L22D6RA61 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L17D6RBQ6 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L19D6RCP7 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L20D6RJB6 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 STAT3P40763 770 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 GSCP56915 257 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L24Q0WX57 530 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 OVGP1Q12889 678 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 GPS1Q13098 491 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 KIF22Q14807 665 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 MMEL1Q495T6 779 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 USP17L6PQ6QN14 398 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 WNT8AQ9H1J5 351 aa16.08■□□□□ 0.17
CASC3-201ENST00000264645 UPP2O95045 317 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 IWS1Q96ST2 819 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 RXFP1Q9HBX9 757 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 B2RBV5 119 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 HADHQ16836 314 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 FBXO11Q86XK2 927 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CD302Q8IX05 232 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 USP17L5A8MUK1 530 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ACADSP16219 412 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 DDB1Q16531 1140 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CENPPQ6IPU0 288 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 VTI1AQ96AJ9 217 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 PHTF1Q9UMS5 762 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 C2CD2Q9Y426 696 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ATP4AP20648 1035 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CACNA2D1P54289 1103 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ATG16L1Q676U5 607 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 FRMD5Q7Z6J6 570 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ICA1LQ8NDH6 482 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 MTBPQ96DY7 904 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 EPHB6O15197 1021 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 DRD4P21917 467 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 COMTP21964 271 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ASPHQ12797 758 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 GRM4Q14833 912 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CXorf38Q8TB03 319 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 RNF217Q8TC41 542 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 SCINQ9Y6U3 715 aa16.07■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 SAT1P21673 171 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 BTKQ06187 659 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ANKMY2Q8IV38 441 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CPXCR1Q8N123 301 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 LPXNO60711 386 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ATP9AO75110 1047 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ITIH2P19823 946 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 SUSD4Q5VX71 490 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ANO5Q75V66 913 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 PDP2Q9P2J9 529 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ARHGAP10A1A4S6 786 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 RARGP13631 454 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 XRCC4Q13426 336 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 PKN1Q16512 942 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 AOC3Q16853 763 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CCDC125Q86Z20 511 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 TTC25Q96NG3 672 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 AGPAT1Q99943 283 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CALN1Q9BXU9 219 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 RGL1Q9NZL6 768 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.06■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 H3BRJ5 948 aa16.05■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 O00370 1275 aa16.05■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 GGPS1O95749 300 aa16.05■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 CDK8P49336 464 aa16.05■□□□□ 0.16
CASC3-201ENST00000264645 ITGA8P53708 1063 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms