RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243893.10

UBE2C-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 476 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-201ENST00000243893 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.44■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 CAVIN2O95810 425 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 HOXD13P35453 343 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 AMHR2Q16671 573 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 ZPBP2Q6X784 338 aa22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 IQCF3P0C7M6 154 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 CENPPQ6IPU0 288 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.42■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 PDXKO00764 312 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 RPS6KA5O75582 802 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 ERLIN2O94905 339 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 AXLP30530 894 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 KCNA1Q09470 495 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 LPIN1Q14693 890 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 GBP3Q9H0R5 595 aa22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 BICDL2A1A5D9 508 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 GPR182O15218 404 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 TSPAN1O60635 241 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 CCNE1P24864 410 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 PAK1Q13153 545 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 MBTPS1Q14703 1052 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 FAM228AQ86W67 206 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 P2RX5Q93086 422 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.4■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.39■■□□□ 1.18
UBE2C-201ENST00000243893 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TGFB1I1O43294 461 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TIMP1P01033 207 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 GHRP10912 638 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 RFC2P35250 354 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 LRRC63Q05C16 580 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 NFIL3Q16649 462 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 NELFBQ8WX92 580 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC51Q96ER9 411 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.39■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 ALPK3Q96L96 1907 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TOM1L1O75674 476 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 EDN1P05305 212 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 CYP2C18P33260 490 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 LIG4P49917 911 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 PAK2Q13177 524 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 BICD1Q96G01 975 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TSG101Q99816 390 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 TSPY26PQ9H489 355 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 CHST12Q9NRB3 414 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa22.38■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 A0A1B0GUA9 196 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 B4GALT5O43286 388 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 CXCL10P02778 98 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 PROZP22891 400 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 MYBPC2Q14324 1141 aa22.37■■□□□ 1.17
UBE2C-201ENST00000243893 GPNMBQ14956 572 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms