RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2J2P51589 502 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CAPNS2Q96L46 248 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPC6Q9Y210 931 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ADCY6O43306 1168 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOC3O60645 756 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBED6P86452 979 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CCL14Q16627 93 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 XXYLT1Q8NBI6 393 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 DEPTORQ8TB45 409 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 A6NJR5 290 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ADCY3O60266 1144 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 GARTP22102 1010 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CNGA1P29973 690 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ENPEPQ07075 957 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CAPSQ13938 189 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 DGKDQ16760 1214 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 TISP43B9A030 160 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEB2O15479 319 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 AOC2O75106 756 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 C22orf31O95567 290 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ADSSP30520 456 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP2C19P33261 490 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 APLP1P51693 650 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 EFNA5P52803 228 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 TMTC1Q8IUR5 882 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXL18Q96ME1 805 aa24.89■■□□□ 1.58
CAPNS1-207ENST00000589146 ASAP2O43150 1006 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 INSRRP14616 1297 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMC4P43686 418 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 STRN3Q13033 797 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 GRM1Q13255 1194 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 DRP2Q13474 957 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 MEA1Q16626 185 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 NEK11Q8NG66 645 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCB1Q9NQ66 1216 aa24.88■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 H3BRB1 525 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 BFSP1Q12934 665 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 C2orf40Q9H1Z8 148 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 K7ERI5 159 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 CCP110O43303 1012 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 NOL4O94818 638 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF286BP0CG31 522 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT13P13646 458 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 CDK17Q00537 523 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 POU5F1BQ06416 359 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP72Q9P209 647 aa24.86■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 EPHB6O15197 1021 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 PMM2O15305 246 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TFDP1Q14186 410 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 SLFN12LQ6IEE8 588 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 EFCAB12Q6NXP0 572 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 GBP6Q6ZN66 633 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TLK2Q86UE8 772 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC71Q8N4P6 559 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.85■■□□□ 1.57
CAPNS1-207ENST00000589146 BAP1Q92560 729 aa24.85■■□□□ 1.57
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